Research Group: Non-coding transcription
Vores gruppe undersøger de funktionelle konsekvenser af ikke-kodende transskription uafhængigt af lncRNA. Vi studerer, hvordan transskriptionsmekanismen i ikke-kodende DNA-regioner påvirker nærliggende genekspression gennem ændringer i kromatinpakning og -modificering. Et af vores mål er at finde ud af, hvordan denne dynamiske ikke-kodende transskription er en del af plantens evne til at registrere dens omgivende miljø. Dette gør vi ved at studere transskriptionskinetik i forbindelse med plante-miljø interaktioner.
Gener udgør kun en lille del af højtudviklede organismers DNA. På trods af dette bliver de fleste ikke-kodende DNA-sekvenser aktivt transskriberet til lange ikke-kodende RNA-molekyler (lncRNA). Promotere er nogle af de evolutionært bedst bevarede kilder til lncRNA syntetiseret gennem divergent ikke-kodende transskription. Dog er selve lncRNA-molekyler ikke evolutionært bevarede, men selve transskriptionen af dem findes på tværs af mange organismer.
- Epigenetics: We are exploring the effects of chromatin structure on inheritance and functional genomic elements.
- Non-coding DNA: We are testing which of the many DNA sequences in eukaryotic genomes that do not code for proteins (i.e. non-coding DNA) serve a purpose.
- Gene expression: We are characterizing the molecular mechanisms regulation gene expression by RNA polymerase II transcription.
- Genomics: We are developing Next-generation sequencing methods to characterize transcriptional dynamics, gene isoform diversity and chromatin-based genome organization.
- Environmental sensing: We are characterizing how plants adopt to changing temperature at the molecular level to inform novel strategies to combat the effects of climate change.
- Novo Nordisk Foundation Hallas-Møller Investigator Award: This project characterizes the rules and roles of long non-coding RNA.
- European Research Council Starting Grant: This project characterizes the molecular mechanism of gene repression by the act of upstream non-coding transcription in the context of climate change.
- Novo Nordisk Foundation Biotechnology project grant: This project aims to transfer regulation of plant cold tolerance by long non-coding to generate crops with increased resilience to climate change.
- European Molecular Biology Organization Young Investigator Programme: This project supports the characterization of environmental effects on gene expression mediated by non-coding DNA.
Hvis du er interesseret i at lave et projekt, kan du læse mere om dine muligheder i projektdatabasen:
Institut for Plante- og Miljøvidenskab har forskellige bachelor- og kandidatuddannelser:
Gruppemedlemmer
Navn | Titel | Telefon | |
---|---|---|---|
Desire Garcia Pichardo | Adjunkt | +4535327016 | |
Giorgio Gullotta | Ph.d.-stipendiat | +4535327444 | |
Karina Chalenko | Ph.d.-stipendiat | +4535331992 | |
Katerina Adamusová | Postdoc | +4535335655 | |
María Luz Annacondia López | Postdoc | +4535331082 | |
Yu Jin | Postdoc |
Kontakt forskergruppeleder
Sebastian Marquardt
Lektor
E-mail: sebastian.marquardt@plen.ku.dk
Tlf.: +45 35 33 13 05
Nyheder fra Molekylær Plantebiologi
-
SPPS innovation prize for Barbara Ann Halkier
22.05.2019 -
Overraskende resultater kaster nyt lys på fotosyntese
15.08.2018 -
De skal knække koden for junk-DNA
13.09.2017 -
ERC Starting Grant for mapping genetic punctuation
12.09.2017 -
Ny forskning i plante-transportproteiner overrasker forskere
13.03.2017 -
Sådan får vi aktuel forskning på skoleskemaet
09.12.2016