Witold Piotr Kot

Witold Piotr Kot

Tenure Track Adjunkt


  1. Udgivet

    Used Nasogastric Feeding Tubes from Neonates Contain Infant-Specific Bacterial Profiles

    Meinich Juhl, S., Angeliki Krogfelt, K., Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris & Krych, Lukasz, 2023, I: Microorganisms. 11, 6, 11 s., 1365.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    A Humanized Diet Profile May Facilitate Colonization and Immune Stimulation in Human Microbiota-Colonized Mice

    Moreno-Indias, I., Lundberg, R., Krych, Lukasz, Metzdorff, S. B., Kot, Witold, Sørensen, Dorte Bratbo, Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Camilla Hartmann Friis & Hansen, Axel Kornerup, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 15 s., 1336.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Investigation of the bacteriophage community in induced lysates of undefined mesophilic mixed-strain DL-cultures using classical and metagenomic approaches

    Muhammed, Musemma Kedir, Olsen, M. L., Kot, Witold, Neve, H., Castro Mejia, J. L., Janzen, T., Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2018, I: International Journal of Food Microbiology. 272, s. 61-72 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Metagenomic analysis of dairy bacteriophages: extraction method and pilot study on whey samples derived from using undefined and defined mesophilic starter cultures

    Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Mahony, J., Castro Mejia, J. L., Krych, Lukasz, Hansen, L. H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J., van Sinderen, D. & Vogensen, Finn Kvist, 2017, I: Applied and Environmental Microbiology. 83, 19, 15 s., e00888-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Parasite-Probiotic Interactions in the Gut: Bacillus sp. and Enterococcus faecium Regulate Type-2 Inflammatory Responses and Modify the Gut Microbiota of Pigs During Helminth Infection

    Myhill, L. J., Stolzenbach, S., Mejer, Helena, Krych, Lukasz, Jakobsen, S. R., Kot, Witold, Skovgaard, K., Canibe, N., Nejsum, P., Nielsen, Dennis Sandris, Thamsborg, Stig Milan & Williams, Andrew Richard, 2022, I: Frontiers in Immunology. 12, 793260.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    The first characterized phage against a member of the ecologically important sphingomonads reveals high dissimilarity against all other known phages

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Carstens, A. B., Browne, P., Lametsch, Rene, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, I: Scientific Reports. 7, 10 s., 13566.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Draft genome sequence of MCPA-degrading Sphingomonas sp. strain ERG5, isolated from a groundwater aquifer in Denmark

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Sørensen, S. R. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Genome Announcements. 3, 1, 2 s., e01529-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Detection of nucleotide modifications in bacteria and bacteriophages: Strengths and limitations of current technologies and software

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Moineau, S., Hansen, Lars Hestbjerg & Riber, Leise, 2023, I: Molecular Ecology. 32, 6, s. 1236-1247 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Genetic rearrangements in Pseudomonas amygdali pathovar aesculi shape coronatine plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Winther-Have, Caroline Sophie W, Thomsen, Iben Margrete, Jackson, R. W., Rabiey, M., Hennessy, Rosanna Catherine, Bak, Frederik, Kot, Witold, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Carstens, Alexander Byth & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Infection, Genetics and Evolution. 113, 10 s., 105486.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A novel Queuovirinae lineage of Pseudomonas aeruginosa phages encode dPreQ0 DNA modifications with a single GA motif that provide restriction and CRISPR Cas9 protection in vitro

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Cui, L., Dedon, P., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 16, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Enterococcus phage Nonaheksakonda infecting clinical isolates of Enterococcus faecalis represents a new lineage in the family Siphoviridae

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, K. J., Plöger, M., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Archives of Virology. 166, s. 593-599 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment

    Olsen, Nikoline S., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Viruses. 12, 9, 21 s., 986.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Salmonella phage akira, infecting selected Salmonella enterica Enteritidis and Typhimurium strains, represents a new lineage of bacteriophages

    Olsen, Nikoline S., Lametsch, Rene, Wagner, N., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2022, I: Archives of Virology. 167, s. 2049–2056

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    A New High-Throughput Screening Method for Phages: Enabling Crude Isolation and Fast Identification of Diverse Phages with Therapeutic Potential

    Olsen, N. S., Hendriksen, N. B., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 3, s. 137-148

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    A Rare, Virulent Clostridium perfringens Bacteriophage Susfortuna Is the First Isolated Bacteriophage in a New Viral Genus

    Pedersen, Julie Stenberg, Kot, Witold, Plöger, M., Lametsch, Rene, Neve, H., Franz, C. M. A. P. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 230-236 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Pectobacterium Phage Jarilo Displays Broad Host Range and Represents a Novel Genus of Bacteriophages Within the Family Autographiviridae

    Pedersen, Julie Stenberg, Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold, Neve, H. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 237-244 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Genome sequences of two Leuconostoc pseudomesenteroides strains isolated from Danish dairy starter cultures

    Pedersen, T. B., Kot, Witold, Hansen, L. H., Sørensen, Søren Johannes, Broadbent, J. R., Vogensen, Finn Kvist & Ardö, Ylva Margareta, 2014, I: Genome Announcements. 2, 3, s. 2 e00484-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Faecal virome transplantation decreases symptoms of type 2 diabetes and obesity in a murine model

    Rasmussen, Torben Sølbeck, Mentzel, Caroline M. Junker, Kot, Witold, Castro-Mejiá, J. L., Zuffa, S., Swann, J. R., Hansen, Lars Hestbjerg, Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Axel Kornerup & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut. 69, 12, s. 2122-2130 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Mouse vendor influence on the bacterial and viral gut composition exceeds the effect of diet

    Rasmussen, Torben Sølbeck, de Vries, L., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Castro-Mejía, J. L., Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Axel Kornerup & Nielsen, Dennis Sandris, 2019, I: Viruses. 11, 5, 15 s., 435.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Inter-vendor variance of enteric eukaryotic DNA viruses in specific pathogen free C57BL/6N mice

    Rasmussen, Torben Sølbeck, Jakobsen, Rasmus Riemer, Castro-Mejía, J. L., Kot, Witold, Thomsen, Allan Randrup, Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2021, I: Research in Veterinary Science. 136, s. 1-5 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    CRISPR-Cas provides limited phage immunity to a prevalent gut bacterium in gnotobiotic mice

    Rasmussen, Torben Sølbeck, Koefoed, A. K., Deng, Ling, Muhammed, Musemma Kedir, Rousseau, G. M., Kot, Witold, Sprotte, S., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, Axel Kornerup, Vogensen, Finn Kvist, Moineau, S. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: ISME Journal. 17, s. 432–442

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Housing temperature influences exercise training adaptations in mice

    Raun, Steffen Henning, Henriquez-Olguín, Carlos, Karavaeva, Iuliia, Ali, Mona Sadek, Møller, Lisbeth L V, Kot, Witold, Castro-Mejía, J. L., Nielsen, Dennis Sandris, Gerhart-Hines, Zach, Richter, Erik A. & Sylow, Lykke, 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 1560.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Gut and immune effects of bioactive milk factors in preterm pigs exposed to prenatal inflammation

    Ren, S., Hui, Y., Goericke-Pesch, S., Pankratova, Stanislava, Kot, Witold, Pan, X., Thymann, Thomas, Sangild, Per Torp & Nguyen, Duc Ninh, 2019, I: American Journal of Physiology: Gastrointestinal and Liver Physiology. 317, 1, s. G67-G77

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Subclinical necrotizing enterocolitis-induced systemic immune suppression in neonatal preterm pigs

    Ren, S., Pan, X., Hui, Y., Kot, Witold, Gao, Fei, Sangild, Per Torp & Nguyen, Duc Ninh, 2021, I: American Journal of Physiology - Gastrointestinal and Liver Physiology. 321, 1, s. G18-G28

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 15105675