Witold Piotr Kot
Tenure Track Adjunkt
Microbial Ecology and Biotechnology
Thorvaldsensvej 40
1871 Frederiksberg C
- Udgivet
Impaired skeletal muscle hypertrophy signaling and amino acid deprivation response in Apoe knockout mice with an unhealthy lipoprotein distribution
Agergaard, J., Zillmer, M. C. F., Castro-Mejía, J. L., Mertz, K., Kot, Witold, Højfeldt, Grith Stougaard, van Hall, Gerrit, Nielsen, Dennis Sandris, Schjerling, Peter & Holm, Lars Morten, 2021, I: Scientific Reports. 11, 15 s., 16423.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms
Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metaviromes Reveal the Dynamics of Pseudomonas Host-Specific Phages Cultured and Uncultured by Plaque Assay
Alanin, K. W. S., Forero Junco, Laura Milena, Jørgensen, J. B., Nielsen, Tue Kjærgaard, Rasmussen, Morten Arendt, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Viruses. 13, 6, 21 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four novel Curtobacterium phages isolated from environmental samples
Alanin, K. W. S., Olsen, Nikoline S., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Nielsen, Tue Kjærgaard, Rothgardt, M. M., Russel, A. M., Wagner, N., Lametsch, Rene, Bak, Frederik, Hennessy, Rosanna Catherine, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Archives of Virology. 168, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three novel Erwinia billingiae phages isolated from organic waste represent three new genera
Alanin, K. W. S., Olsen, Nikoline S., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Nielsen, Tue Kjærgaard, Wagner, N., Lametsch, Rene, Bak, Frederik, Hennessy, Rosanna Catherine, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Archives of Virology. 168, 7 s., 71.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Classification of lytic bacteriophages attacking dairy Leuconostoc starter strains
Ali, Y., Kot, Witold, Atamer, Z., Hinrichs, J., Vogensen, Finn Kvist, Heller, K. J. & Neve, H., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 12, s. 3628-3636 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combined use of Bacteriophage K and a novel Bacteriophage to reduce Staphylococcus aureus biofilm formation
Alves, D. R., Gaudion, A., Bean, J. E., Esteban, P. P., Arnot, T. C., Harper, D. R., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Enright, M. C. & Jenkins, A. T. A., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 21, s. 6694-6703 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic and Ecogenomic Characterization of Proteus mirabilis Bacteriophages
Alves, D. R., Nzakizwanayo, J., Dedi, C., Olympiou, C., Hanin, A., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lametsch, Rene, Gahan, C. G. M., Schellenberger, P., Ogilvie, L. A. & Jones, B. V., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-14 1783.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel virocell metabolic potential revealed in agricultural soils by virus-enriched soil metagenome analysis
Braga, L. P. P., Coutinho, F. H., Amgarten, D. E., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2021, I: Environmental Microbiology Reports. 13, 3, s. 348-354 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of phages on soil bacterial communities and nitrogen availability under different assembly scenarios
Braga, L. P. P., Spor, A., Kot, Witold, Breuil, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2020, I: Microbiome. 8, 1, 14 s., 52.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Mobilome: Metagenomic Analysis of Circular Plasmids, Viruses, and Other Extrachromosomal Elements
Browne, Patrick Denis, Kot, Witold, Jørgensen, T. S. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, Horizontal Gene Transfer: Methods and Protocols. Cruz, F. D. L. (red.). Humana Press, s. 253-264 (Methods in Molecular Biology, Bind 2075).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms
Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fecal filtrate transplantation protects against necrotizing enterocolitis
Brunse, Anders, Deng, Ling, Pan, X., Hui, Y., Castro Mejia, J. L., Kot, Witold, Nguyen, Duc Ninh, Secher, Jan Bojsen-Møller, Nielsen, Dennis Sandris & Thymann, Thomas, 2022, I: The ISME Journal. 16, s. 686–694Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A novel six-phage cocktail reduces Pectobacterium atrosepticum soft rot infection in potato tubers under simulated storage conditions
Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 maj 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 9, s. 1-8 fnz101.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimizing protocols for extraction of bacteriophages prior to metagenomic analyses of phage communities in the human gut
Castro Mejia, J. L., Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, L. H., Vogensen, Finn Kvist & Nielsen, Dennis Sandris, 2015, I: Microbiome. 3, 14 s., 64.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physical fitness in community-dwelling older adults is linked to dietary intake, gut microbiota, and metabolomic signatures
Castro-Mejia, J. L., Khakimov, B., Krych, L., Bülow, J., Bechshøft, R. L., Højfeldt, G., Mertz, K. H., Garne, E. S., Schacht, S. R., Ahmad, H. F., Kot, W., Hansen, L. H., Perez-Cueto, F. J. A., Lind, M. V., Lassen, A. J., Tetens, I., Jensen, T., Reitelseder, S., Jespersen, A. P., Holm, L. & 2 flere, , 2020, I: Aging Cell. 19, 3, 13 s., e13105.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Restitution of gut microbiota in Ugandan children administered with probiotics (Lactobacillus rhamnosus GG and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12) during treatment for severe acute malnutrition
Castro-Mejía, J. L., O’Ferrall, S., Krych, Lukasz, O’Mahony, E., Namusoke, H., Lanyero, B., Kot, Witold, Nabukeera-Barungi, N., Michaelsen, Kim F., Mølgaard, Christian, Friis, Henrik, Grenov, Benedikte & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut Microbes. 11, 4, s. 855-867 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Two New Dickeya dadantii Phages with Odd Growth Patterns Expand the Diversity of Phages Infecting Soft Rot Pectobacteriaceae
Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 251-259 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria
Dougherty, Peter Erdmann, Nielsen, Tue Kjærgaard, Riber, Leise, Lading, H. H., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Raaijmakers, J. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Degradation of mecoprop in polluted landfill leachate and waste water in a moving bed biofilm reactor
Escolà Casas, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Johansen, A. & Bester, K., 2017, I: Water Research. 121, s. 213-220Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Complete Genome Sequences of Three Lactiplantibacillus plantarum Strains Isolated from Traditional Iranian Raw Milk Motal Cheese
Fatemizadeh, S. S., Krych, Lukasz, Castro-Mejía, J. L., Stefanova, Denitsa Vladimirova, Kot, Witold, Najafi, M. B. H. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: Microbiology Resource Announcements. 12, 1, 3 s., e0047922.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Pretreatment Prevotella-to-Bacteroides ratio and salivary amylase gene copy number as prognostic markers for dietary weight loss
Hjorth, Mads Fiil, Christensen, Lars, Larsen, T. M., Roager, Henrik Munch, Krych, Lukasz, Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris, Ritz, C. & Astrup, A., 2020, I: American Journal of Clinical Nutrition. 111, 5, s. 1079-1086 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Supplementation of a lacto-fermented rapeseed-seaweed blend promotes gut microbial- and gut immune-modulation in weaner piglets
Hui, Y., Tamez-Hidalgo, P., Cieplak, T., Satessa, G. D., Kot, Witold, Kjærulff, S., Nielsen, M. O., Nielsen, Dennis Sandris & Krych, Lukasz, 2021, I: Journal of Animal Science and Biotechnology. 12, 14 s., 85.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Donor-dependent fecal microbiota transplantation efficacy against necrotizing enterocolitis in preterm pigs
Hui, Y., Vestergaard, G., Deng, Ling, Kot, Witold, Thymann, Thomas, Brunse, Anders & Nielsen, Dennis Sandris, 2022, I: npj Biofilms and Microbiomes. 8, 1, 12 s., 48.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 15105675
Flest downloads
-
3026
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
1776
downloads
Bacteriophages of Leuconostoc, Oenococcus, and Weissella
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1279
downloads
Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet