Søren Bak

Søren Bak

Professor

Medlem af:

    Kommentarer til publikationsliste

    ResearcherID H-4404-2014

    ORCID 0000-0003-4100-115X


    1. 2013
    2. Udgivet

      Integrative analysis of metabolomics and transcriptomics data: a unified model framework to identify underlying system pathways

      Brink-Jensen, K., Bak, Søren, Jørgensen, Kirsten & Ekstrøm, Claus Thorn, 2013, I: P L o S One. 8, 9, 8 s., e72116.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      Male-to-female transfer of 5-hydroxytryptophan glucoside during mating in Zyagena filipendulae (Lepidoptera)

      Zagrobelny, Mika, Motawie, Mohammed Saddik, Olsen, C. E., Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2013, I: Insect Biochemistry and Molecular Biology. 43, 11, s. 1037-1044 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Plant P450s as versatile drivers for evolution of species-specific chemical diversity

      Hamberger, B. R. & Bak, Søren, 2013, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 368, 1612, 16 s., 20120426.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Plant defense against insect herbivores

      Fürstenberg-Hägg, J., Zagrobelny, Mika & Bak, Søren, 2013, I: International Journal of Molecular Sciences (Online). 14, 5, 56 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      The use of trimethylsilyl cyanide derivatization for robust and broad-spectrum high-throughput gas chromatography–mass spectrometry based metabolomics

      Khakimov, Bekzod, Motawie, Mohammed Saddik, Bak, Søren & Engelsen, Søren Balling, 2013, I: Analytical and Bioanalytical Chemistry. 405, 28, s. 9193-9205 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Visualizing metabolite distribution and enzymatic conversion in plant tissues by desorption electrospray ionization mass spectrometry imaging

      Li, B., Baden, C. K., Hansen, N. K. K., Jørgensen, Kirsten, Kannangara, R. M., Bak, Søren, Takos, A. M., Rook, F., Hansen, S. H., Møller, Birger Lindberg, Janfelt, Christian & Bjarnholt, Nanna, 2013, I: Plant Journal. 74, 6, s. 1059-1071 74.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. 2012
    9. Udgivet

      Biosynthesis of rhodiocyanosides in Lotus japonicus: Rhodiocyanoside A is synthesized from (Z)-2-methylbutanaloxime via 2-methyl-2-butenenitrile

      Saito, S., Motawie, Mohammed Saddik, Olsen, C. E., Møller, Birger Lindberg & Bak, Søren, 2012, I: Phytochemistry. 77, s. 260-267 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Plant metabolomics: resolution and quantification of elusive peaks in liquid chromatography–mass spectrometry profiles of complex plant extracts using multi-way decomposition methods

      Khakimov, Bekzod, Amigo Rubio, J. M., Bak, Søren & Engelsen, Søren Balling, 2012, I: Journal of Chromatography A. 1266, s. 84-94 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      UDP-glycosyltransferases from the UGT73C subfamily in Barbarea vulgaris catalyse Sapogenin 3-O-glucosylation in Saponin-mediated Insect resistance

      Augustin, J. M., Drok, S., Shinoda, T., Sanmiya, K., Nielsen, J. K., Khakimov, Bekzod, Olsen, C. E., Hansen, E. H., Poulsen, V. K., Ekstrøm, Claus Thorn, Hauser, T. P. & Bak, Søren, 2012, I: Plant Physiology. 160, 4, s. 1881-1895 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. 2011
    13. Udgivet

      Barbarea vulgaris linkage map and quantitative trait loci for saponins, glucosinolates, hairiness and resistance to the herbivore Phyllotreta nemorum

      Poulsen, V. K., Nielsen, J. K., Augustin, J. M., Torp, A. M., Bak, Søren & Andersen, S. B., 2011, I: Phytochemistry. 72, 2-3, s. 188-198 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      Biosynthesis of the cyanogenic glucosides linamarin and lotaustralin in cassava: isolation, biochemical, characterization, and expression pattern of CYP71E7, the oxime-metabolizing cytochrome P450 enzyme

      Jørgensen, Kirsten, Morant, A. V., Morant, M., Jensen, N. B., Olsen, C. E., Kannangara, R. M., Motawie, Mohammed Saddik, Møller, Birger Lindberg & Bak, Søren, 2011, I: Plant Physiology. 155, 1, s. 282-292 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. Udgivet

      Convergent evolution in biosynthesis of cyanogenic defence compounds in plants and insects

      Jensen, N. B., Zagrobelny, Mika, Hjernø, K., Olsen, C. E., Hougton-Larsen, J., Borch-Jensen, J., Møller, Birger Lindberg & Bak, Søren, 2011, I: Nature Communications. 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    16. Udgivet

      Cytochromes P450

      Bak, Søren, Beisson, F., Bishop, G., Hamberger, B. R., Höfer, R., Paquette, S. & Werck-Reichhart, D., 2011, The arabidopsis book. American Society of Plant Biologists, 56 s.

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Molecular activities, biosynthesis and evolution of triterpenoid saponins

      Augustin, J. M., Poulsen, V. K., Andersen, S. B. & Bak, Søren, 2011, I: Phytochemistry. 72, 6, s. 435-457 23 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. 2010
    19. Udgivet
    20. Udgivet
    21. Udgivet

      The role of saponins in the tripartite interaction between Barbarea vulgaris (Brassicaceae), flea beetles and white rust.

      van Mölken, M. A. R., Hauser, T. P., Andersen, S. B., Augustin, J. M., Bak, Søren, Poulsen, V. K., Munk, Lisa & Nielsen, J. K., 2010.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    22. Udgivet

      Interactions between Barbarea vulgaris, flea beetles and white rust

      Hauser, T. P., Andersen, S. B., Augustin, J. M., Bak, Søren, Poulsen, V. K. & Munk, Lisa, 2010.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    23. Udgivet

      Metabolomic, transcriptional, hormonal, and signaling cross-talk in Superroot2

      Morant, M. D., Ekstrøm, Claus Thorn, Ulvskov, Peter, Kristensen, C., Rudemo, M. E., Olsen, C. E., Hansen, J., Jørgensen, Kirsten, Jørgensen, B., Møller, Birger Lindberg & Bak, Søren, 2010, I: Molecular Plant. 3, 1, s. 192-211 20 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    24. Udgivet

      Planters naturlige forsvar mod forskellige samtidige skadevoldere

      Hauser, T. P., Nielsen, J. K., Munk, Lisa, Poulsen, V. K., Bak, Søren, van Mölken, T. & Andersen, S. B., 2010, Plantekongres 2010: sammendrag af indlæg: 12-14 januar i Herning Kongrescenter. Dansk Landbrugsrådgivning, s. 402-403 2 s.

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskning

    25. 2009
    26. Udgivet

      454 pyrosequencing based transcriptome analysis of Zygaena filipendulae with focus on genes involved in biosynthesis of cyanogenic glucosides

      Zagrobelny, Mika, Scheibye-Alsing, K., Jensen, N. B., Møller, Birger Lindberg, Gorodkin, Jan & Bak, Søren, 2009, I: BMC Genomics. 10, 574, 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    27. Udgivet

      Lotus japonicus as a model system to study evolution and function of cyanogenic glucosides in plant-insect interactions

      Bak, Søren, Saito, S., Takos, A. M., Zagrobelny, Mika, Bjarnholt, Nanna, Jensen, N. B., Rook, F., Martin, C. R. & Møller, Birger Lindberg, 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    28. Udgivet

      A web-based resource for the Arabidopsis P450, cytochromes b5, NADPH-cytochrome P450 reductases, and family 1 glycosyltransferases

      Paquette, S. M., Jensen, K. & Bak, Søren, 2009, I: Phytochemistry. 70, 17-18, s. 1940-1947 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    29. Udgivet

      Ecogenomic and ecometabolomic approaches to unraveling natural plant resistance to insects

      Poulsen, V. K., Augustin, J. M., Andersen, S. B., Ekstrøm, Claus Thorn, Nielsen, J. K., Olsen, C. E. & Bak, Søren, 2009. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragPaperForskning

    30. Udgivet

      Ecometabolomic Approach for Identification of Defensive Compounds in Plants towards Herbivorous Insects

      Poulsen, V. K., Andersen, S. B., Ekstrøm, Claus Thorn, Nielsen, J. K., Olsen, C. E. & Bak, Søren, 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    31. Udgivet

      Effect of glucuronosylation on anthocyanin color stability

      Osmani, S. A., Hansen, E. H., Malien-Aubert, C., Olsen, C. E., Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2009, I: Journal of Agricultural and Food Chemistry. 57, 8, s. 3149-3155 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    32. Udgivet
    33. Udgivet

      Identification of defense compounds in Barbarea vulgaris against the herbivore Phyllotreta nemorum by an ecometabolomic approach

      Poulsen, V. K., Ekstrøm, Claus Thorn, Andersen, S. B., Nielsen, J. K., Olsen, C. E. & Bak, Søren, 2009, I: Plant Physiology. 151, 4, s. 1977-1990 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    34. Udgivet
    35. Udgivet

      Microarray analysis of phenylpropanoid metabolism in the model legume Lotus japonicus

      Shelton, D. A., Bailey, P., Mikkelsen, L., Takos, A. M., Bak, Søren, Wang, T., Rook, F. & Martin, C. R., 2009.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    36. Udgivet

      Microarray analysis of phenylpropanoid metabolism in the model legume Lotus japonicus

      Shelton, D. A., Bailey, P., Takos, A. M., Bak, Søren, Wang, T., Rook, F. & Martin, C. R., 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    37. Udgivet

      Microarray analysis of phenylpropanoid metabolism in the model legume Lotus japonicus

      Shelton, D. A., Bailey, P., Mikkelsen, L., Takos, A. M., Bak, Søren, Wang, T., Rook, F. & Martin, C. R., 2009. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    38. Udgivet

      Microarray analysis of phenylpropanoid metabolism in the model legume Lotus japonicus

      Shelton, D. A., Bailey, P., Takos, A. M., Bak, Søren, Wang, T., Rook, F. & Martin, C. R., 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    39. Udgivet

      Natural variation in hydroxynitrile glucosides in the model legume Lotus japonicus

      Mikkelsen, L., Bjarnholt, Nanna, Olsen, C. E., Takos, A. M., Wang, T., Møller, Birger Lindberg, Bak, Søren, Martin, C. R. & Rook, F., 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    40. Udgivet

      Recruitment of cytocromes P450 for evolution of new natural products in Lotus japonicus

      Saito, S., Engelbrecht, J., Olsen, C. E., Møller, Birger Lindberg & Bak, Søren, 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    41. Udgivet

      Regulation of isoflavonoid biosynthesis in the model legume Lotus japonicus

      Shelton, D. A., Bailey, P., Olsen, C. E., Mikkelsen, L., Takos, A. M., Wang, T., Bak, Søren, Rook, F. & Martin, C. R., 2009.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    42. Udgivet

      Substrate specificity of plant UDP-dependent glycosyltransferases predicted from crystal structures and homology modeling

      Osmani, S. A., Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2009, I: Phytochemistry. 70, 3, s. 325-347 23 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    43. Udgivet

      Unraveling the biosynthetic pathway of triterpenoid saponins in Barbarea vulgaris

      Augustin, J. M., Poulsen, V. K., Andersen, S. B., Nielsen, J. K. & Bak, Søren, 2009. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    44. Udgivet

      Unraveling the biosynthetic pathway of triterpenoid saponins in Barbarea vulgaris

      Augustin, J. M., Poulsen, V. K., Andersen, S. B., Nielsen, J. K. & Bak, Søren, 2009. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    45. 2008
    46. Udgivet

      CYP703 catalyzes in-chain hydroxylation of lauric acid to provide building blocks for sporopollenin synthesis

      Morant, M., Jørgensen, Kirsten, Schaller, H., Pinot, F., Olsen, C. E., Werck-Reichhart, D., Møller, Birger Lindberg & Bak, Søren, 2008.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    47. Udgivet

      Catalytic key amino acids and UDP-sugar donor specificity of a plant glucuronosyltransferase, UGT94B1: molecular modeling substantiated by site-specific mutagenesis and biochemical analyses

      Osmani, S. A., Bak, Søren, Imberty, A., Olsen, C. E. & Møller, Birger Lindberg, 2008, I: Plant Physiology. 148, s. 1295-1308 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    48. Udgivet

      Cyanogenesis in plants and arthropods

      Zagrobelny, Mika, Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2008, I: Phytochemistry. 69, 7, s. 1457-1468 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    49. Udgivet

      Cyanogenic glucosides as determinants of feeding preference in Zygaena filipendulae (Linnaeus, 1758) (Lepidoptera, Zygaenidae)

      Zagrobelny, Mika, Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2008, Les chaires du musée des confluences: vol. 2: l'expérimentation. Drouet, E. (red.). Musée des Confluences, s. 113-122 10 s.

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

    50. Udgivet

      Cyanogenic glucosides in primary and secondary metabolism

      Sánchez-Pérez, R., Zagrobelny, Mika, Jørgensen, Kirsten, Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2008.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    51. Udgivet

      Diversification of an ancient theme: hydroxynitrile glucosides

      Bjarnholt, Nanna, Rook, F., Motawie, Mohammed Saddik, Cornett, Claus, Jørgensen, C., Olsen, C. E., Jaroszewski, J. W., Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2008, I: Phytochemistry. 69, 7, s. 1507-1516 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    52. Udgivet

      Diversification of an ancient theme: hydroxynitrile glucosides

      Bjarnholt, Nanna, Rook, F., Motawie, Mohammed Saddik, Cornett, Claus, Olsen, C. E., Jaroszewski, J. W., Bak, Søren & Møller, Birger Lindberg, 2008.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    53. Udgivet

      Erratum: Cyanogenic glycosides: A case study for evolution and application of cytochromes P450 (Phytochemistry Reviews (2006) 5, (309-329) DOI: 10.1007/s11101-006-9033-1)

      Bak, Søren, Paquette, S. M., Morant, M., Morant, A. V., Saito, S., Bjarnholt, Nanna, Zagrobelny, Mika, Jørgensen, K., Osmani, S., Hamann, T., Simonsen, H. T., Pérez, R. S., Van Heeswijck, T. B., Jørgensen, Bodil & Møller, Birger Lindberg, 2008, I: Phytochemistry Reviews. 7, 1, s. 209 1 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

    54. Udgivet

      Is evolutionary speed related to function in the Arabidopsis cytochrome P450 multigene family?

      Engelbrecht, J. & Bak, Søren, 2008.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    55. Udgivet

      Is evolutionary speed related to function in the Arabidopsis cytochrome P450 multigene family?

      Engelbrecht, J. & Bak, Søren, 2008.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    56. Udgivet

      Isoflavonoid Biosynthesis in the Model Legume Lotus japonicus

      Shelton, D., Bailey, P., Olsen, C. E., Mikkelsen, L., Takos, A., Bak, Søren, Rook, F., Wang, T. & Martin, C., 2008.

      Publikation: KonferencebidragPosterForskning

    ID: 4240264