Lars Hestbjerg Hansen

Lars Hestbjerg Hansen

Professor


  1. 2024
  2. E-pub ahead of print

    Field and laboratory guidelines for reliable bioinformatic and statistical analysis of bacterial shotgun metagenomic data

    Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Dunn, Rob, Hansen, Lars Hestbjerg, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2024, (E-pub ahead of print) I: Critical Reviews in Biotechnology.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Insights into the circular: The cryptic plasmidome and its derived antibiotic resistome in the urban water systems

    Yu, Z., He, Wanli, Klincke, F., Madsen, Jonas Stenløkke, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, Joseph & Sørensen, Søren Johannes, 2024, I: Environment International. 183, 12 s., 108351.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. 2023
  5. Udgivet

    A novel Queuovirinae lineage of Pseudomonas aeruginosa phages encode dPreQ0 DNA modifications with a single GA motif that provide restriction and CRISPR Cas9 protection in vitro

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Cui, L., Dedon, P., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 16, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Cessation of grazing causes biodiversity loss and homogenization of soil food webs

    Schrama, M., Quist, C. W., Arjen De Groot, G., Cieraad, E., Ashworth, D., Laros, I., Hansen, Lars Hestbjerg, Leff, J., Fierer, N. & Bardgett, R. D., 2023, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 290, 2011, 12 s., 20231345.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Detection of nucleotide modifications in bacteria and bacteriophages: Strengths and limitations of current technologies and software

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Moineau, S., Hansen, Lars Hestbjerg & Riber, Leise, 2023, I: Molecular Ecology. 32, 6, s. 1236-1247 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet
  9. Udgivet

    Four novel Curtobacterium phages isolated from environmental samples

    Alanin, K. W. S., Olsen, Nikoline S., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Nielsen, Tue Kjærgaard, Rothgardt, M. M., Russel, A. M., Wagner, N., Lametsch, Rene, Bak, Frederik, Hennessy, Rosanna Catherine, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Archives of Virology. 168, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Genetic rearrangements in Pseudomonas amygdali pathovar aesculi shape coronatine plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Winther-Have, Caroline Sophie W, Thomsen, Iben Margrete, Jackson, R. W., Rabiey, M., Hennessy, Rosanna Catherine, Bak, Frederik, Kot, Witold, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Carstens, Alexander Byth & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Infection, Genetics and Evolution. 113, 10 s., 105486.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Intestinal epigenotype of Atlantic salmon (Salmo salar) associates with tenacibaculosis and gut microbiota composition

    Hansen, Søren Blikdal, Bozzi, D., Mak, Sarah Siu Tze, Clausen, C. G., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kodama, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Gilbert, M Thomas P & Limborg, Morten Tønsberg, 2023, I: Genomics. 115, 3, 9 s., 110629.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Pheno- and Genotyping of Three Novel Bacteriophage Genera That Target a Wheat Phyllosphere Sphingomonas Genus

    Riber, Leise, Carstens, Alexander Byth, Dougherty, Peter Erdmann, Roy, C., Willenbücher, K., Hille, F., Franz, C. M. A. P. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Microorganisms. 11, 7, 17 s., 1831.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Pruning Wound Protection Products Induce Alterations in the Wood Mycobiome Profile of Grapevines

    Del Frari, G., Aggerbeck, M. R., Gobbi, Alex, Ingrà, C., Volpi, L., Nascimento, T., Ferrandino, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Ferreira, R. B., 2023, I: Journal of Fungi. 9, 4, 20 s., 488.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Replication Protein Rep Provides Selective Advantage to Viruses in the Presence of CRISPR-Cas Immunity

    Zhang, W., Bhoobalan-Chitty, Y., Zhai, Xichuan, Hui, Y., Hansen, Lars Hestbjerg, Deng, Ling & Peng, Xu, 2023, I: CRISPR Journal. 6, 1, s. 32-42

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet
  16. Udgivet

    Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria

    Dougherty, Peter Erdmann, Nielsen, Tue Kjærgaard, Riber, Leise, Lading, H. H., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Raaijmakers, J. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. 2022
  18. Udgivet

    A global microbiome survey of vineyard soils highlights the microbial dimension of viticultural terroirs

    Gobbi, Alex, Acedo, A., Imam, N., Santini, R. G., Ortiz-Alvarez, R., Ellegaard-Jensen, L., Belda, I. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: Communications Biology . 5, 9 s., 241.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Antibiotic resistance genes are differentially mobilized according to resistance mechanism

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Browne, Patrick Denis & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: GigaScience. 11, 17 s., giac072.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Bacteriophages Roam the Wheat Phyllosphere

    Forero Junco, Laura Milena, Alanin, K. W. S., Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold, Gobbi, Alex & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: Viruses. 14, 2, 13 s., 244.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Combining reverse osmosis and microbial degradation for remediation of drinking water contaminated with recalcitrant pesticide residue

    Schostag, M. D., Gobbi, Alex, Fini, M. N., Ellegaard-Jensen, L., Aamand, J., Hansen, Lars Hestbjerg, Muff, J. & Albers, C. N., 2022, I: Water Research. 216, 12 s., 118352.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Complete Genome Sequence and Benzophenone-3 Mineralisation Potential of Rhodococcus sp. USK10, A Bacterium Isolated from Riverbank Sediment

    Martin, J. D., Krüger, U. S., Zervas, A., Schostag, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Aamand, J., Hansen, Lars Hestbjerg & Ellegaard-Jensen, L., 2022, I: Applied Microbiology. 2, s. 104-112 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges

    Meyer, F., Fritz, A., Deng, Z. L., Koslicki, D., Lesker, T. R., Gurevich, A., Robertson, G., Alser, M., Antipov, D., Beghini, F., Bertrand, D., Brito, J. J., Brown, C. T., Buchmann, J., Buluç, A., Chen, B., Chikhi, R., Clausen, P. T. L. C., Cristian, A., Dabrowski, P. W. & 83 flere, Darling, A. E., Egan, R., Eskin, E., Georganas, E., Goltsman, E., Gray, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Hofmeyr, S., Huang, P., Irber, L., Jia, H., Jørgensen, T. S., Kieser, S. D., Klemetsen, T., Kola, A., Kolmogorov, M., Korobeynikov, A., Kwan, J., LaPierre, N., Lemaitre, C., Li, C., Limasset, A., Malcher-Miranda, F., Mangul, S., Marcelino, V. R., Marchet, C., Marijon, P., Meleshko, D., Mende, D. R., Milanese, A., Nagarajan, N., Nissen, Jakob Nybo, Nurk, S., Oliker, L., Paoli, L., Peterlongo, P., Piro, V. C., Porter, J. S., Rasmussen, Simon, Rees, E. R., Reinert, K., Renard, B., Robertsen, E. M., Rosen, G. L., Ruscheweyh, H. J., Sarwal, V., Segata, N., Seiler, E., Shi, L., Sun, F., Sunagawa, S., Sørensen, Søren Johannes, Thomas, A., Tong, C., Trajkovski, M., Tremblay, J., Uritskiy, G., Vicedomini, R., Wang, Z., Wang, Z., Wang, Z., Warren, A., Willassen, N. P., Yelick, K., You, R., Zeller, G., Zhao, Z., Zhu, S., Zhu, J., Garrido-Oter, R., Gastmeier, P., Hacquard, S., Häußler, S., Khaledi, A., Maechler, F., Mesny, F., Radutoiu, S., Schulze-Lefert, P., Smit, N., Strowig, T., Bremges, A., Sczyrba, A. & McHardy, A. C., 2022, I: Nature Methods. 19, 4, s. 429-440

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Effect of gluten-free diet and antibiotics on murine gut microbiota and immune response to tetanus vaccination

    Kihl, Pernille, Krych, Lukasz, Deng, Ling, Hansen, Lars Hestbjerg, Buschard, K., Skov, Søren, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2022, I: Plos One. 17, 4, 21 s., e0266719.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Genetic, Phenotypic and Metabolic Diversity of Yeasts From Wheat Flag Leaves

    Gouka, L., Vogels, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Raaijmakers, J. M. & Cordovez, V., 2022, I: Frontiers in Plant Science. 13, 13 s., 908628.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Gut Microbiome and Its Cofactors Are Linked to Lipoprotein Distribution Profiles

    Castro-Mejía, J. L., Khakimov, Bekzod, Aru, Violetta, Lind, M. V., Ahlmann, Eva Garne, Paulová, P., Tavakkoli, E., Hansen, Lars Hestbjerg, Smilde, Age Klaas, Holm, L., Engelsen, Søren Balling & Nielsen, Dennis Sandris, 2022, I: Microorganisms. 10, 11, 2156.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet
  28. Udgivet

    Machine learning and deep learning applications in microbiome research

    Hernandez Medina, Ricardo, Kutuzova, Svetlana, Nielsen, Knud Nor, Johansen, Joachim, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Mads & Rasmussen, Simon, 2022, I: ISME Communications. 2, 7 s., 98.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Muskoxen homogenise soil microbial communities and affect the abundance of methanogens and methanotrophs

    Aggerbeck, M. R., Nielsen, Tue Kjærgaard, Mosbacher, J. B., Schmidt, N. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: Science of the Total Environment. 827, 9 s., 153877.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Salmonella phage akira, infecting selected Salmonella enterica Enteritidis and Typhimurium strains, represents a new lineage of bacteriophages

    Olsen, Nikoline S., Lametsch, Rene, Wagner, N., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2022, I: Archives of Virology. 167, s. 2049–2056

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Successful treatment of Clostridioidesdifficile infection with single-donor faecal microbiota transplantation capsules

    Cold, F., Svensson, C. K., Christensen, A. H., Günther, S., Petersen, Andreas Munk, Hansen, Lars Hestbjerg & Helms, Morten, 2022, I: Danish Medical Journal. 69, 2, 10 s., 09210712.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Successful treatment of Clostridioidesdifficile infection with single-donorfaecal microbiota transplantation capsules

    Cold, F., Svensson, C. K., Günther, S., Petersen, Andreas Munk, Hansen, Lars Hestbjerg & Helms, Morten, 2022, I: Danish Medical Journal. 69, 2, 10 s., A09210712.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    The Bacillus cereus Strain EC9 Primes the Plant Immune System for Superior Biocontrol of Fusarium oxysporum

    Madriz Ordenana, Kenneth, Pazarlar, S., Jørgensen, Hans Jørgen Lyngs, Nielsen, Tue Kjærgaard, Zhang, Y., Nielsen, K. L., Hansen, Lars Hestbjerg & Thordal-Christensen, Hans, 2022, I: Plants. 11, 5, 19 s., 687.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. 2021
  35. Udgivet

    An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms

    Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Application of wood ash leads to strong vertical gradients in soil pH changing prokaryotic community structure in forest top soil

    Bang-Andreasen, T., Peltre, M., Ellegaard-Jensen, L., Hansen, Lars Hestbjerg, Ingerslev, Morten, Rønn, Regin, Jacobsen, C. S. & Kjøller, Rasmus, 2021, I: Scientific Reports. 11, 10 s., 742.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Paenibacillus sp. Strain 37, a Plant Growth-Promoting Bacterium Isolated from the Rhizosphere of Abies nordmanniana (Nordmann Fir)

    Garcia-Lemos, A. M., Hennessy, Rosanna Catherine, Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg & Nicolaisen, Mette Haubjerg, 2021, I: Microbiology Resource Announcements. 10, 8, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Complete Genome Sequence of the Cytokinin-Producing Biocontrol Strain Pseudomonas fluorescens G20-18

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Mekureyaw, M. F., Hansen, Lars Hestbjerg, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Roitsch, Thomas Georg & Hennessy, Rosanna Catherine, 2021, I: Microbiology Resource Announcements. 10, 30, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Engraftment of strictly anaerobic oxygen-sensitive bacteria in irritable bowel syndrome patients following fecal microbiota transplantation does not improve symptoms

    Browne, Patrick Denis, Cold, F., Petersen, Andreas Munk, Halkjær, S. I., Christensen, A. H., Günther, S. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Gut Microbes. 13, 1, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Enterococcus phage Nonaheksakonda infecting clinical isolates of Enterococcus faecalis represents a new lineage in the family Siphoviridae

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, K. J., Plöger, M., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Archives of Virology. 166, s. 593-599 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Epigenetic Memories: The Hidden Drivers of Bacterial Persistence?

    Riber, Leise & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Trends in Microbiology. 29, 3, s. 190-194 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskning

  42. Udgivet

    Extension of Plant Phenotypes by the Foliar Microbiome

    Hawkes, C. V., Kjøller, Rasmus, Raaijmakers, J. M., Riber, Leise, Christensen, Svend, Rasmussen, Simon, Christensen, Jan H., Dahl, A. B., Westergaard, Jesper Cairo, Nielsen, Mads, Brown-Guedira, G. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Annual Review of Plant Biology. 72, s. 823-846 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Global transcriptome analysis of Rhizobium favelukesii LPU83 in response to acid stress

    Nilsson, J. F., Castellani, L. G., Draghi, W. O., Mogro, E. G., Wibberg, D., Winkler, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Schluüter, A., Puühler, A., Kalinowski, J., Tejerizo, G. A. T. & Pistorio, M., 2021, I: FEMS Microbiology Ecology. 97, 1, fiaa235.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Lead Drives Complex Dynamics of a Conjugative Plasmid in a Bacterial Community

    Cyriaque, V., Madsen, Jonas Stenløkke, Fievez, L., Leroy, B., Hansen, Lars Hestbjerg, Bureau, F., Sørensen, Søren Johannes & Wattiez, R., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 655903.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms

    Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Metaviromes Reveal the Dynamics of Pseudomonas Host-Specific Phages Cultured and Uncultured by Plaque Assay

    Alanin, K. W. S., Forero Junco, Laura Milena, Jørgensen, J. B., Nielsen, Tue Kjærgaard, Rasmussen, Morten Arendt, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Viruses. 13, 6, 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Novel virocell metabolic potential revealed in agricultural soils by virus-enriched soil metagenome analysis

    Braga, L. P. P., Coutinho, F. H., Amgarten, D. E., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2021, I: Environmental Microbiology Reports. 13, 3, s. 348-354 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Pre-clinical evaluation of the effect of co-medication with antibiotics and oral steroids in Gottingen Minipigs on the biological activity of the probiotic medicinal product TSO (Trichuris suis ova)

    Prosberg, M. V., Kringel, H., Kapel, J. S., Kapel, B. S., Fredensborg, Brian Lund, Petersen, Andreas Munk, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Kapel, H. S., Jacobsen, K. R., Mikkelsen, L. F. & Kapel, Christian, 2021, I: Parasitology Research. 120, s. 743-746

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Systematic review with meta-analysis: encapsulated faecal microbiota transplantation - evidence for clinical efficacy

    Cold, F., Baunwall, S. M. D., Dahlerup, J. F., Petersen, Andreas Munk, Hvas, C. L. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Therapeutic Advances in Gastroenterology. 14, 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    The aerobiome uncovered: Multi-marker metabarcoding reveals potential drivers of turn-over in the full microbial community in the air

    de Groot, G. A., Geisen, S., Wubs, E. R. J., Meulenbroek, L., Laros, I., Snoek, L. B., Lammertsma, D. R., Hansen, Lars Hestbjerg & Slim, P. A., 2021, I: Environment International. 154, 106551.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    The complete genome of 2,6-dichlorobenzamide (BAM) degrader Aminobacter sp. MSH1 suggests a polyploid chromosome, phylogenetic reassignment, and functions of plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Horemans, B., Lood, C., T’Syen, J., van Noort, V., Lavigne, R., Ellegaard-Jensen, L., Hylling, Ole, Aamand, J., Springael, D. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Scientific Reports. 11, 12 s., 18943.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    The effect of faecal microbiota transplantation on abdominal pain, stool frequency, and stool form in patients with moderate-to-severe irritable bowel syndrome: results from a randomised, double-blind, placebo-controlled study

    Madsen, A. M. A., Halkjaer, S. I., Christensen, A. H., Guenther, S., Browne, Patrick Denis, Kallemose, T., Hansen, Lars Hestbjerg & Petersen, Andreas Munk, 2021, I: Scandinavian Journal of Gastroenterology. 56, 7, s. 761-769 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    The gut microbiome and abiotic factors as potential determinants of postprandial glucose responses: A single-arm meal study

    Nestel, N., Hvass, J. D., Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Krych, Lukasz, Nielsen, Dennis Sandris, Dragsted, Lars Ove & Roager, Henrik Munch, 2021, I: Frontiers in Nutrition. 7, 9 s., 594850.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. 2020
  55. Udgivet

    Mesorhizobium intechi sp. nov. isolated from nodules of Lotus tenuis in soils of the Flooding Pampa, Argentina

    Julia Estrella, M., Florencia Fontana, M., Cumpa Velasquez, L. M., Torres Tejerizo, G. A., Diambra, L., Hansen, Lars Hestbjerg, Pistorio, M. & Ines Sannazzaro, A., 2020, I: Systematic and Applied Microbiology. 43, 1, 8 s., 126044.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    A New High-Throughput Screening Method for Phages: Enabling Crude Isolation and Fast Identification of Diverse Phages with Therapeutic Potential

    Olsen, N. S., Hendriksen, N. B., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 3, s. 137-148

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    A Rare, Virulent Clostridium perfringens Bacteriophage Susfortuna Is the First Isolated Bacteriophage in a New Viral Genus

    Pedersen, Julie Stenberg, Kot, Witold, Plöger, M., Lametsch, Rene, Neve, H., Franz, C. M. A. P. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 230-236 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Bioaugmented Sand Filter Columns Provide Stable Removal of Pesticide Residue From Membrane Retentate

    Ellegaard-Jensen, L., Schostag, M. D., Fini, M. N., Badawi, N., Gobbi, Alex, Aamand, J. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Frontiers in Water. 2, 13 s., 603567.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community

    Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  60. Udgivet

    Complete Genome and Plasmid Sequences of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Enteritidis PT1, Obtained from the Salmonella Reference Laboratory at Public Health England, Colindale, United Kingdom

    Anwar, M. Z., Zervas, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Barker, G., Anesio, A. M. & Jacobsen, C. S., 2020, I: Microbiology Resource Announcements. 9, 2, 2 s., ARTN e01064-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    Detection of preQ0 deazaguanine modifications in bacteriophage CAjan DNA using Nanopore sequencing reveals same hypermodification at two distinct DNA motifs

    Kot, Witold, Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hutinet, G., de Crecy-Lagard, V., Cui, L., Dedon, P. C., Carstens, Alexander Byth, Moineau, S., Swairjo, M. A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Nucleic Acids Symposium Series. 48, 18, s. 10383-10396 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  62. Udgivet

    Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment

    Olsen, Nikoline S., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Viruses. 12, 9, 21 s., 986.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet

    Faecal virome transplantation decreases symptoms of type 2 diabetes and obesity in a murine model

    Rasmussen, Torben Sølbeck, Mentzel, Caroline M. Junker, Kot, Witold, Castro-Mejiá, J. L., Zuffa, S., Swann, J. R., Hansen, Lars Hestbjerg, Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Axel Kornerup & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut. 69, 12, s. 2122-2130 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  64. Udgivet

    Fecal Microbiota Transplantation in the Treatment of Chronic Pouchitis: A Systematic Review

    Cold, F., Kousgaard, S. J., Halkjaer, S. I., Petersen, Andreas Munk, Nielsen, H. L., Thorlacius-Ussing, O. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Microorganisms. 8, 9, 17 s., 1433.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  65. Udgivet

    Fermentable Dietary Fiber Promotes Helminth Infection and Exacerbates Host Inflammatory Responses

    Myhill, L. J., Stolzenbach, S., Mejer, Helena, Jakobsen, S. R., Hansen, Tina Vicky Alstrup, Andersen, D., Brix, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Krych, Lukasz, Nielsen, Dennis Sandris, Nejsum, P., Thamsborg, Stig Milan & Williams, Andrew Richard, 2020, I: The Journal of Immunology. 204, 11, s. 3042-3055 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  66. Udgivet

    GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms

    Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  67. Udgivet

    Impact of phages on soil bacterial communities and nitrogen availability under different assembly scenarios

    Braga, L. P. P., Spor, A., Kot, Witold, Breuil, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2020, I: Microbiome. 8, 1, 14 s., 52.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  68. Udgivet

    Influence of vintage, geographic location and cultivar on the structure of microbial communities associated with the grapevine rhizosphere in vineyards of San Juan Province, Argentina

    Aguilar, M. O., Gobbi, Alex, Browne, Patrick Denis, Ellegaard-Jensen, L., Hansen, Lars Hestbjerg, Semorile, L. & Pistorio, M., 2020, I: PLoS ONE. 15, 12, 19 s., 0243848.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  69. Udgivet

    Inulin and milk mineral fortification of a pork sausage exhibits distinct effects on the microbiome and biochemical activity in the gut of healthy rats

    Thøgersen, R., Castro-Mejía, J. L., Sundekilde, U. K., Hansen, Lars Hestbjerg, Gray, N., Kuhnle, G., Jørgensen, Niklas Rye, Hansen, Axel Kornerup, Nielsen, Dennis Sandris & Bertram, H. C., 2020, I: Food Chemistry. 331, 10 s., 127291.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  70. Udgivet

    Isolation and characterisation of novel phages infecting Lactobacillus plantarum and proposal of a new genus, "Silenusvirus"

    Kyrkou, I., Carstens, Alexander Byth, Ellegaard-Jensen, L., Kot, Witold, Zervas, A., Djurhuus, Amaru Miranda, Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 10 s., 8763.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  71. Land use as a driver for protist community structure in soils under agricultural use across Europe

    Santos, S. S., Schöler, A., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg, Schloter, M. & Winding, A., 2020, I: Science of the Total Environment. 717, 137228.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  72. Udgivet

    Metagenomic analysis of planktonic riverine microbial consortia using nanopore sequencing reveals insight into river microbe taxonomy and function: [incl. Erratum]

    Reddington, K., Eccles, D., O'Grady, J., Drown, D. M., Hansen, L. H., Nielsen, T. K., Ducluzeau, A-L., Leggett, R. M., Heavens, D., Peel, N., Snutch, T. P., Bayega, A., Oikonomopoulos, S., Ragoussis, J., Barry, T., van der Helm, E., Jolic, D., Richardson, H., Jansen, H., Tyson, J. R. & 2 flere, Jain, M. & Brown, B. L., 2020, I: GigaScience. 9, 6, 12 s., 053.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  73. Udgivet

    Microbiota in foods from Inuit traditional hunting

    Hauptmann, A. L., Paulová, P., Hansen, Lars Hestbjerg, Sicheritz-Pontén, Thomas, Mulvad, G. & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: PLoS ONE. 15, 1, 15 s., e0227819.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  74. Udgivet

    Pectobacterium Phage Jarilo Displays Broad Host Range and Represents a Novel Genus of Bacteriophages Within the Family Autographiviridae

    Pedersen, Julie Stenberg, Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold, Neve, H. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 237-244 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  75. Udgivet

    Physical fitness in community-dwelling older adults is linked to dietary intake, gut microbiota, and metabolomic signatures

    Castro-Mejia, J. L., Khakimov, B., Krych, L., Bülow, J., Bechshøft, R. L., Højfeldt, G., Mertz, K. H., Garne, E. S., Schacht, S. R., Ahmad, H. F., Kot, W., Hansen, L. H., Perez-Cueto, F. J. A., Lind, M. V., Lassen, A. J., Tetens, I., Jensen, T., Reitelseder, S., Jespersen, A. P., Holm, L. & 2 flere, Engelsen, Søren Balling & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Aging Cell. 19, 3, 13 s., e13105.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  76. Udgivet

    Potential Rhodopsin- and Bacteriochlorophyll-Based Dual Phototrophy in a High Arctic Glacier

    Zeng, Y., Chen, X., Madsen, A. M., Zervas, A., Nielsen, Tue Kjærgaard, Andrei, A., Lund-Hansen, L. C., Liu, Y. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: mBio. 11, 6, 22 s., e02641-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  77. Udgivet

    Presentation of Three Novel Tailed Phages Targeting Multiple Strains of Pseudomonas syringae

    Jørgensen, J. B., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Neve, H., Morris, C. E. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 245-250 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  78. Udgivet

    Releasing the microbes from old bones: the effect of different DNA extraction protocols on microbial community profiling

    Eriksen, A. M. H., Puetz, Lara Christine, Rocha, C., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: STAR: Science & Technology of Archaeological Research. 6, 1, s. 1-15 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  79. Udgivet

    Seasonal epiphytic microbial dynamics on grapevine leaves under biocontrol and copper fungicide treatments

    Gobbi, Alex, Kyrkou, I., Filippi, E., Ellegaard-Jensen, L. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 681.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  80. Udgivet

    The Mobilome: Metagenomic Analysis of Circular Plasmids, Viruses, and Other Extrachromosomal Elements

    Browne, Patrick Denis, Kot, Witold, Jørgensen, T. S. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, Horizontal Gene Transfer: Methods and Protocols. Cruz, F. D. L. (red.). Humana Press, s. 253-264 (Methods in Molecular Biology, Bind 2075).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  81. Udgivet

    Two New Dickeya dadantii Phages with Odd Growth Patterns Expand the Diversity of Phages Infecting Soft Rot Pectobacteriaceae

    Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 251-259 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  82. Udgivet

    Two novel bacteriophage genera from a groundwater reservoir highlight subsurface environments as underexplored biotopes in bacteriophage ecology

    Hylling, O., Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Hansen, M., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Johansen, A., Ellegaard-Jensen, L. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  83. Udgivet

    Under the Christmas Tree: Belowground Bacterial Associations With Abies nordmanniana Across Production Systems and Plant Development

    Garcia-Lemos, A. M., Gobbi, Alex, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Hansen, Lars Hestbjerg, Roitsch, Thomas Georg, Veierskov, Bjarke & Nybroe, O., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 17 s., 198.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  84. Udgivet

    Unravelling plasmidome distribution and interaction with its hosting microbiome

    Kav, A. B., Rozov, R., Bogumil, D., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Benhar, I., Halperin, E., Shamir, R. & Mizrahi, I., 2020, I: Environmental Microbiology. 22, 1, s. 32-44

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  85. 2019
  86. Udgivet

    A novel hybrid concept for implementation in drinking water treatment targets micropollutant removal by combining membrane filtration with biodegradation

    Hylling, O., Nikbakht Fini, M., Ellegaard-Jensen, L., Muff, J., Madsen, H. T., Aamand, J. & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 dec. 2019, I: Science of the Total Environment. 694, s. 1-12 133710.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  87. Udgivet

    Genomics of Aerobic Photoheterotrophs in Wheat Phyllosphere Reveals Divergent Evolutionary Patterns of Photosynthetic Genes in Methylobacterium spp

    Zervas, A., Zeng, Y., Madsen, A. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 okt. 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 10, s. 2895-2908

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  88. Udgivet

    A novel six-phage cocktail reduces Pectobacterium atrosepticum soft rot infection in potato tubers under simulated storage conditions

    Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 maj 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 9, s. 1-8 fnz101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  89. Udgivet

    Multidonor FMT capsules improve symptoms and decrease fecal calprotectin in ulcerative colitis patients while treated - an open-label pilot study

    Cold, F., Browne, Patrick Denis, Günther, S., Halkjaer, S. I., Petersen, Andreas Munk, Al-Gibouri, Z., Hansen, Lars Hestbjerg & Christensen, A. H., 4 apr. 2019, I: Scandinavian Journal of Gastroenterology. 54, 3, s. 289-296 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  90. Characterization of the Wood Mycobiome of Vitis vinifera in a Vineyard Affected by Esca. Spatial Distribution of Fungal Communities and Their Putative Relation With Leaf Symptoms

    Del Frari, G., Gobbi, Alex, Aggerbeck, M. R., Oliveira, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Ferreira, R. B., 2019, I: Frontiers in Plant Science. 10, 19 s., 910.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  91. Udgivet

    Complete Genome Sequences of Highly Arsenite-Resistant Bacteria Brevibacterium sp. Strain CS2 and Micrococcus luteus AS2

    Sher, S., Rehman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Nielsen, Tue Kjærgaard, 2019, I: Microbiology Resource Announcements. 8, 31, 2 s., e00531-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  92. Udgivet

    Expanding the Diversity of Myoviridae Phages Infecting Lactobacillus plantarum - A Novel Lineage of Lactobacillus Phages Comprising Five New Members

    Kyrkou, I., Carstens, Alexander Byth, Ellegaard-Jensen, L., Kot, Witold, Zervas, A., Djurhuus, Amaru Miranda, Neve, H., Hansen, M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: Viruses. 11, 7, 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  93. Fungicides and the Grapevine Wood Mycobiome: A Case Study on Tracheomycotic Ascomycete Phaeomoniella chlamydospora Reveals Potential for Two Novel Control Strategies

    Del Frari, G., Gobbi, Alex, Aggerbeck, M. R., Oliveira, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Ferreira, R. B., 2019, I: Frontiers in Plant Science. 10, 1405.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  94. Udgivet

    Genomic and Ecogenomic Characterization of Proteus mirabilis Bacteriophages

    Alves, D. R., Nzakizwanayo, J., Dedi, C., Olympiou, C., Hanin, A., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lametsch, Rene, Gahan, C. G. M., Schellenberger, P., Ogilvie, L. A. & Jones, B. V., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-14 1783.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  95. Udgivet

    Intra- and inter-field diversity of 2,4-dichlorophenoxyacetic acid-degradative plasmids and their tfd catabolic genes in rice fields of the Mekong delta in Vietnam

    Nguyen, T. P. O., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Horemans, B., Sørensen, Søren Johannes, De Mot, R. & Springael, D., 2019, I: FEMS Microbiology Ecology. 95, 1, s. 1-11 fiy214.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  96. Udgivet

    Mouse vendor influence on the bacterial and viral gut composition exceeds the effect of diet

    Rasmussen, Torben Sølbeck, de Vries, L., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Castro-Mejía, J. L., Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Axel Kornerup & Nielsen, Dennis Sandris, 2019, I: Viruses. 11, 5, 15 s., 435.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  97. Udgivet

    Multi-omics and potential applications in wine production

    Sirén, K., Mak, Sarah Siu Tze, Fischer, U., Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2019, I: Current Opinion in Biotechnology. 56, s. 172-178

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  98. Udgivet

    The Genome and mRNA Transcriptome of the Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartia tonsa Dana Improve the Understanding of Copepod Genome Size Evolution

    Jørgensen, T. S., Petersen, Bent, Petersen, H. C. B., Browne, Patrick Denis, Prost, S., Stillman, J. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Hansen, B. W., 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 5, s. 1440-1450

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  99. Udgivet

    The Whole Genome Sequence and mRNA Transcriptome of the Tropical Cyclopoid Copepod Apocyclops royi

    Jorgensen, T. S., Nielsen, B. L. H., Petersen, Bent, Browne, Patrick Denis, Hansen, B. W. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2019, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 9, 5, s. 1295-1302

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  100. 2018
  101. Udgivet

    Inter-laboratory testing of the effect of DNA blocking reagent G2 on DNA extraction from low-biomass clay samples

    Jacobsen, C. S., Nielsen, T. K., Vester, J. K., Stougaard, P., Nielsen, J. L., Voriskova, J., Winding, A., Baldrian, P., Liu, B., Frostegard, A., Pedersen, D., Tveit, A. T., Svenning, M. M., Tebbe, C. C., Ovreas, L., Jakobsen, P. B., Blazewicz, S. J., Hubablek, V., Bertilsson, S., Hansen, L. H. & 4 flere, Cary, S. C., Holben, W. E., Ekelund, Flemming & Bælum, J., 2018, I: Scientific Reports. 8, s. 1-6 6 s., 5711.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  102. Udgivet

    The impact of exercise training and resveratrol supplementation on gut microbiota composition in high-fat diet fed mice

    Brandt, N., Kotowska, D., Kristensen, C. M., Olesen, J., Lützhøft, Ditte Olsen, Halling, Jens Frey, Hansen, M., Al-Soud, W. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Kiilerich, P. & Pilegaard, Henriette, 2018, I: Physiological Reports. 6, 20, s. 1-11 e13881.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  103. 2017
  104. Udgivet

    Response of the bacterial community in an on-farm biopurification system, to which diverse pesticides are introduced over an agricultural season

    Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Smalla, K., Riber, Leise & Sørensen, Søren Johannes, okt. 2017, I: Environmental Pollution. 229, s. 854-862 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  105. Degradation of mecoprop in polluted landfill leachate and waste water in a moving bed biofilm reactor

    Escolà Casas, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Johansen, A. & Bester, K., 2017, I: Water Research. 121, s. 213-220

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  106. Evolution of Sphingomonad Gene Clusters Related to Pesticide Catabolism Revealed by Genome Sequence and Mobilomics of Sphingobium herbicidovorans MH

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Rasmussen, M., Demanèche, S., Cecillon, S., Vogel, T. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, I: Genome Biology and Evolution. 9, 9, s. 2477-2490

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  107. Udgivet

    Plasmids, viruses, and other circular elements in rat gut

    Jørgensen, T. S., Hansen, M. A., Xu, Z., Tabak, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 30 s.

    Publikation: Working paperForskning

  108. Udgivet

    The first characterized phage against a member of the ecologically important sphingomonads reveals high dissimilarity against all other known phages

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Carstens, A. B., Browne, P., Lametsch, Rene, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, I: Scientific Reports. 7, 10 s., 13566.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  109. 2016
  110. Udgivet

    Bacterial communities in termite fungus combs are comprised of consistent gut deposits and contributions from the environment

    Otani, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Poulsen, Michael, 2016, I: Microbial Ecology. 71, 1, s. 207-220 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  111. Udgivet

    Diverse gene functions in a soil mobilome

    Luo, W., Xu, Z., Riber, Leise, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Soil Biology & Biochemistry. 101, s. 175-183 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  112. Udgivet

    Enhanced plasmid loss in bacterial populations exposed to the antimicrobial compound irgasan delivered from interpenetrating polymer network silicone hydrogels

    Riber, Leise, Burmølle, Mette, Alm, M., Milani, S. M., Thomsen, P., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2016, I: Plasmid. 87-88, s. 72-78 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  113. Establishment of Bacterial Herbicide Degraders in a Rapid Sand Filter for Bioremediation of Phenoxypropionate-Polluted Groundwater

    Feld, L., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg, Aamand, J. & Albers, C. N., 2016, I: Applied and Environmental Microbiology. 82, 3, s. 878-887

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  114. Udgivet

    Exploring the complex response to linuron of bacterial communities from biopurification systems by means of cultivation-independent methods

    Dealtry, S., Nour, E. H., Holmsgaard, P. N., Ding, G. C., Weichelt, V., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Springael, D. & Smalla, K., 2016, I: F E M S Microbiology Ecology. 92, 2, 12 s., fiv157.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  115. Udgivet

    Plasmid metagenomics reveals multiple antibiotic resistance gene classes among the gut microbiomes of hospitalised patients

    Jitwasinkul, T., Suriyaphol, P., Tangphatsornruang, S., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Permpikul, C., Rongrungruang, Y. & Tribuddharat, C., 2016, I: Journal of Global Antimicrobial Resistance. 6, s. 57-66 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  116. Udgivet
  117. 2015
  118. Udgivet

    Acromyrmex leaf-cutting ants have simple gut microbiota with nitrogen-fixing potential

    Sapountzis, P., Zhukova, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Schiøtt, M. & Boomsma, Jacobus J., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 16, s. 5527-5537 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  119. Udgivet

    Bacterial symbiont sharing in Megalomyrmex social parasites and their fungus-growing ant hosts

    Liberti, J., Sapountzis, P., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Adams, R. M. M. & Boomsma, Jacobus J., 2015, I: Molecular Ecology. 24, 12, s. 3151-3169 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  120. Udgivet

    Broad host range plasmids can invade an unexpectedly diverse fraction of a soil bacterial community

    Klümper, U., Riber, Leise, Dechesne, A., Sannazzaro, A. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Smets, B. F., 2015, I: I S M E Journal. 9, s. 934-945 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  121. Udgivet

    Colonic lesions, cytokine profiles, and gut microbiota in plasminogen-deficient mice

    Vestergaard, Bill, Krych, Lukasz, Lund, L. R., Jørgensen, B. M. P., Hansen, Lars Hestbjerg, Jensen, Henrik Elvang, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2015, I: Comparative Medicine. 65, 5, s. 382-397 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  122. Udgivet

    Current strategies for mobilome research

    Jørgensen, T. S., Kiil, A. S., Hansen, M. A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Frontiers in Microbiology. 5, 6 s., 750.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  123. Draft Genome Sequence of Isoproturon-Mineralizing Sphingomonas sp. SRS2, Isolated from an Agricultural Field in the United Kingdom

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Sørensen, S. R. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Genome Announcements. 3, 3, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  124. Udgivet

    Draft genome sequence of MCPA-degrading Sphingomonas sp. strain ERG5, isolated from a groundwater aquifer in Denmark

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Sørensen, S. R. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Genome Announcements. 3, 1, 2 s., e01529-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  125. Udgivet

    Host-specific and pH-dependent microbiomes of copepods in an extensive rearing system

    Skovgaard, A., Castro Mejia, J. L., Hansen, Lars Hestbjerg & Nielsen, Dennis Sandris, 2015, I: PLOS ONE. 10, 7, s. e0132516 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  126. Udgivet

    Identification of the amidase BbdA that initiates biodegradation of the groundwater micropollutant 2,6-dichlorobenzamide (BAM) in Aminobacter sp. MSH1

    T'Syen, J., Tassoni, R., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Leroy, B., Sekhar, A., Wattiez, R., De Mot, R. & Springael, D., 2015, I: Environmental Science & Technology (Washington). 49, 19, s. 11703-11713 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  127. Udgivet

    Natural hot spots for gain of multiple resistances: arsenic and antibiotic resistances in heterotrophic, aerobic bacteria from marine hydrothermal vent fields

    Farias, P., Santo, C. E., Branco, R., Francisco, R., Santos, S., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Morais, P. V., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 7, s. 2534-2543 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  128. Udgivet

    The effect of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei L. casei W8® on blood levels of triacylglycerol is independent of colonisation

    Bjerg, A. T., Sørensen, M. B., Krych, Lukasz, Hansen, Lars Hestbjerg, Astrup, A., Kristensen, M. B. & Nielsen, Dennis Sandris, 2015, I: Beneficial Microbes. 6, 3, s. 263-269 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  129. 2014
  130. Udgivet

    A maternal gluten-free diet reduces inflammation and diabetes incidence in the offspring of NOD mice

    Hansen, Camilla Hartmann Friis, Krych, Lukasz, Buschard, K., Metzdorff, S. B., Nellemann, C. L., Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Frøkiær, Hanne, Skov, Søren & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Diabetes. 63, 8, s. 2821-2832 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  131. Udgivet

    An improved method for including upper size range plasmids in metamobilomes

    Norman, A., Riber, Leise, Luo, W., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, 12 s., e104405.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  132. Udgivet

    Bioinformatic approaches reveal metagenomic characterization of soil microbial community

    Xu, Z., Hansen, M. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Jacquiod, S. J. A. & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: P L o S One. 9, 4, 11 s., e93445.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  133. Udgivet

    Characterization of the gut microbiota in leptin deficient obese mice: correlation to inflammatory and diabetic parameters

    Ellekilde, M., Krych, Lukasz, Hansen, Camilla Hartmann Friis, Hufeldt, M. R., Dahl, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Vogensen, Finn Kvist, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Research in Veterinary Science. 96, 2, s. 241-250 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  134. Udgivet

    Combined use of Bacteriophage K and a novel Bacteriophage to reduce Staphylococcus aureus biofilm formation

    Alves, D. R., Gaudion, A., Bean, J. E., Esteban, P. P., Arnot, T. C., Harper, D. R., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Enright, M. C. & Jenkins, A. T. A., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 21, s. 6694-6703 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  135. Udgivet

    DPS - a rapid method for genome sequencing of DNA-containing bacteriophages directly from a single plaque

    Kot, Witold, Vogensen, Finn Kvist, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2014, I: Journal of Virological Methods. 196, s. 152-156 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  136. Udgivet

    Exploring the immediate and long-term impact on bacterial communities in soil amended with animal and urban organic waste fertilizers using pyrosequencing and screening for horizontal transfer of antibiotic resistance

    Riber, Leise, Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. B. S., Bergmark, L., Brejnrod, A. D., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 206-224 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  137. Udgivet

    High-resolution melt analysis for rapid comparison of bacterial community compositions

    Hjelmsø, M. H., Hansen, Lars Hestbjerg, Bælum, J., Feld, L., Holben, W. E. & Jacobsen, C. S., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 12, s. 3568-3575 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  138. Udgivet

    Identifying the core microbial community in the gut of fungus-growing termites

    Otani, S., Mikaelyan, A., Nobre, T., Hansen, Lars Hestbjerg, Koné, N. A., Sørensen, Søren Johannes, Aanen, D. K., Boomsma, Jacobus J., Brune, A. & Poulsen, Michael, 2014, I: Molecular Ecology. 23, 18, s. 4631–4644 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  139. Udgivet

    Mercuric reductase genes (merA) and mercury resistance plasmids in High Arctic snow, freshwater and sea-ice brine

    Møller, A. K., Barkay, T., Hansen, M. A., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Boyd, E. S. & Kroer, Niels, 2014, I: FEMS Microbiology Ecology. 87, 1, s. 52-63 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  140. Udgivet

    Mode of delivery shapes gut colonization pattern and modulates regulatory immunity in mice

    Hansen, Camilla Hartmann Friis, Andersen, L. S. F., Krych, Lukasz, Metzdorff, S. B., Hasselby, Jane Preuss, Skov, Søren, Nielsen, Dennis Sandris, Buschard, K., Hansen, Lars Hestbjerg & Hansen, Axel Kornerup, 2014, I: Journal of Immunology. 193, 3, s. 1213-1222 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  141. Udgivet

    Pathogens and host immunity in the ancient human oral cavity

    Warinner, C., Rodrigues, J. F. M., Vyas, R., Trachsel, C., Shved, N., Grossmann, J., Radini, A., Hancock, Y., Tito, R. Y., Fiddyment, S., Speller, C., Hendy, J., Charlton, S., Luder, H. U., Salazar-García, D. C., Eppler, E., Seiler, R., Hansen, L. H., Samaniego Castruita, J. A., Barkow-Oesterreicher, S. & 12 flere, Teoh, K. Y., Kelstrup, C., Olsen, Jesper Velgaard, Nanni, P., Kawai, T., Willerslev, Eske, von Mering, C., Lewis, C. M., Collins, M. J., Gilbert, M Thomas P, Rühli, F. & Cappellini, Enrico, 2014, I: Nature Genetics. 46, s. 336-344 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  142. Udgivet

    Predictors of neutrophilic airway inflammation in young smokers with asthma

    Westergaard, C. G., Munck, C., Petersen, Jens Helby, Porsbjerg, Celeste Michala, Hansen, Lars Hestbjerg & Backer, Vibeke, 2014, I: Journal of Asthma. 51, 4, s. 341-347 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  143. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Jacobsen, S., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2014, I: International Journal of Food Microbiology. 176, s. 29-37 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  144. Udgivet

    Shifts in abundance and diversity of mobile genetic elements after the introduction of diverse pesticides into an on-farm biopurification system over the course of a year

    Dealtry, S., Holmsgaard, P. N., Dunon, V., Jechalke, S., Ding, G., Kroegerrecklenfort, E., Heuer, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Springael, D., Zuehlke, S., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 13, s. 4012-4020 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  145. 2013
  146. Udgivet

    Complete nucleotide sequence of the self-transmissible TOL plasmid pD2RT provides new insight into arrangement of toluene catabolic plasmids

    Jutkina, J., Hansen, Lars Hestbjerg, Li, L., Heinaru, E., Vedler, E., Joesaar, M. & Heinaru, A., jan. 2013, I: Plasmid. 70, 3, s. 393-405 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  147. Characterization of IncN plasmids carrying blaCTX-M-1 and qnr genes in Escherichia coli and Salmonella from animals, the environment and humans

    Dolejska, M., Ville, L., Hasman, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Carattoli, A., 2013, (E-pub ahead of print) I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  148. Udgivet

    Complete genome sequence of Staphylococcus aureus strain M1, a unique t024-ST8-IVa Danish methicillin-resistant S. aureus clone

    Larner-Svensson, H., Worning, P., Bartels, Mette Damkjær, Hansen, Lars Hestbjerg, Boye, K. & Westh, H., 2013, I: Genome Announcements. 1, 3, 2 s., e00336-13.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  149. Udgivet

    Effects of fertilization with urban and agricultural organic wastes in a field trial – Prokaryotic diversity investigated by pyrosequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Bergmark, L., Magid, Jakob, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Soil Biology & Biochemistry. 57, s. 784-893 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  150. Udgivet

    Investigating the diversity of Pseudomonas spp. in soil using culture dependent and independent techniques

    Li, L., Abu Al-Soud, W., Bergmark, L., Riber, Leise, Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2013, I: Current Microbiology. 67, 4, s. 423-430 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  151. Udgivet

    Investigation of the relationship between lactococcal host cell wall polysaccharide genotype and 936 phage receptor binding protein phylogeny

    Mahony, J., Kot, Witold, Murphy, J., Ainsworth, S., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg, Heller, K. J., Sørensen, Søren Johannes, Hammer, K., Cambillau, C., Vogensen, Finn Kvist & Sinderen, D. V., 2013, I: Applied and Environmental Microbiology. 79, 14, s. 4385-4392 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  152. Udgivet

    Large cryoconite aggregates on a Svalbard glacier support a diverse microbial community including ammonia-oxidizing archaea

    Zarsky, J. D., Stibal, M., Hodson, A., Sattler, B., Schostag, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Jacobsen, C. S. & Psenner, R., 2013, I: Environmental Research Letters. 8, 3, 11 s., 035044.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  153. Udgivet

    Novel insight into the genetic context of the cadAB genes from a 4-chloro-2-methylphenoxyacetic acid-degrading Sphingomonas

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Xu, Z., Gozdereliler, E., Aamand, J., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, S. R., 2013, I: P L o S One. 8, 12, 9 s., e83346.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  154. Udgivet

    Simultaneous pyrosequencing of the 16S rRNA, IncP-1 trfA, and merA genes

    Holmsgaard, P. N., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2013, I: Journal of Microbiological Methods. 95, 2, s. 280-284 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  155. Udgivet

    Specificity and stability of the Acromyrmex–Pseudonocardia symbiosis

    Andersen, Sandra Breum, Hansen, Lars Hestbjerg, Sapountzis, P., Sørensen, Søren Johannes & Boomsma, Jacobus J., 2013, I: Molecular Ecology. 22, 16, s. 4307-4321 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  156. Udgivet

    The impact of the conjugative IncP-1 plasmid pKJK5 on multispecies biofilm formation is dependent on the plasmid host

    Røder, Henriette Lyng, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Burmølle, Mette, 2013, I: F E M S Microbiology Letters. 344, 2, s. 186-192 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  157. Udgivet

    The murine lung microbiome in relation to the intestinal and vaginal bacterial communities

    Barfod, K. K., Roggenbuck, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Schjørring, S., Larsen, S. T., Sørensen, Søren Johannes & Krogfelt, K. A., 2013, I: B M C Microbiology. 13, 12 s., 303.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  158. 2012
  159. Udgivet

    454-sequencing reveals stochastic local reassembly and high disturbance tolerance within arbuscular mycorrhizal fungal communities

    Lekberg, K. Y. M., Schnoor, T., Kjøller, Rasmus, Gibbons, S. M., Hansen, Lars Hestbjerg, Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes & Rosendahl, Søren, 2012, I: Journal of Ecology. 100, 1, s. 151-160 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  160. Udgivet

    Assessment of the specificity of Burkholderia and Pseudomonas qPCR assays for detection of these genera in soil using 454 pyrosequencing

    Bergmark, L., Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Microbiology Letters. 333, 1, s. 77-84 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  161. Udgivet
  162. Udgivet
  163. Expansion of the IncX plasmid family for improved identification and typing of novel plasmids in drug-resistant Enterobacteriaceae

    Johnson, T. J., Bielak, E. M., Fortini, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Hasman, H., Debroy, C., Nolan, L. K. & Carattoli, A., 2012, I: Plasmid. 68, 1, s. 43-50 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  164. Udgivet

    Fitness cost: a bacteriological explanation for the demise of the first international methicillin-resistant Staphylococcus aureus epidemic

    Nielsen, K. L., Pedersen, T. M., Udekwu, K. I., Petersen, A., Skov, R. L., Hansen, Lars Hestbjerg, Hughes, D. & Frimodt-Moller, N., 2012, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 67, 6, s. 1325-1332 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  165. Udgivet

    Gut microbiota composition is correlated to grid floor induced stress and behavior in the BALB/c mouse

    Bendtsen, K. M. B., Krych, Lukasz, Sørensen, Dorte Bratbo, Pang, W., Nielsen, Dennis Sandris, Josefsen, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Axel Kornerup, 2012, I: P L o S One. 7, 10, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  166. Udgivet

    Insight from the draft genome of Dietzia cinnamea P4 reveals mechanisms of survival in complex tropical soil habitats and biotechnology potential

    Procópio, L., Alvarez, V. M., Jurelevicius, D. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Cardoso, J. S., Pádula, M., Leitao, Á. C., Seldin, L. & van Elsas, J. D., 2012, I: Antonie van Leeuwenhoek: Journal of Microbiology. 101, 2, s. 289-302 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  167. Udgivet
  168. Udgivet

    Metamobilomics — expanding our knowledge on the pool of plasmid encoded traits in natural environments using high-throughput sequencing

    Li, L., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: Clinical Microbiology and Infection. 18, Suppl. 4, s. 8-11 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  169. Udgivet
  170. Udgivet

    Selection for Cu-tolerant bacterial communities with altered composition, but unaltered richness, via long-term Cu exposure

    Berg, J., Brandt, Kristian Koefoed, Abu Al-Soud, W., Holm, Peter Engelund, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Nybroe, O., 2012, I: Applied and Environmental Microbiology. 78, 20, s. 7438-7446 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  171. Udgivet

    Sequencing of IncX-plasmids suggests ubiquity of mobile forms of a biofilm-promoting gene cassette recruited from Klebsiella pneumoniae

    Burmølle, Mette, Norman, A., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2012, I: PLOS ONE. 7, 7, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  172. Udgivet

    The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer

    Madsen, Jonas Stenløkke, Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 183-195 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  173. Udgivet
  174. 2011
  175. Udgivet
  176. Udgivet

    Bias in bacterial diversity as a result of Nycodenz extraction from bulk soil

    Holmsgaard, P. N., Norman, A., Hede, S. C., Poulsen, P. H. B., Al-Soud, W. A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 14 jul. 2011, I: Soil Biology & Biochemistry. 43, 10, s. 2152-2159 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  177. Udgivet

    Design and Synthesis of a Quintessential Self-Transmissible IncX1 Plasmid, pX1.0

    Hansen, Lars Hestbjerg, Bentzon-Tilia, M., Bentzon-Tilia, S., Norman, A., Rafty, L. & Sørensen, Søren Johannes, maj 2011, I: P L o S One. 6, 5, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  178. Udgivet
  179. Udgivet

    An Unexpected Location of the Arginine Catabolic Mobile Element (ACME) in a USA300-Related MRSA Strain

    Bartels, Mette Damkjær, Hansen, Lars Hestbjerg, Boye, K., Sørensen, Søren Johannes & Westh, Henrik T., 2011, I: P L o S One. 6, 1, 5 s., e16193.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  180. Udgivet
  181. Udgivet

    Fluoroquinolone resistance mechanisms in urinary tract pathogenic Escherichia coli isolated during rapidly increasing fluoroquinolone consumption in a low-use country

    Christiansen, N., Nielsen, L., Jakobsen, L., Stegger, M., Hansen, Lars Hestbjerg & Frimodt-Moller, N., 2011, I: Microbial Drug Resistance. 17, 3, s. 395-406 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  182. Udgivet

    Investigation of diversity of plasmids carrying the blaTEM-52 gene

    Bielak, E. M., Bergenholtz, R. D., Jørgensen, M. S., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Hasman, H., 2011, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 66, 11, s. 2465-74 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  183. Udgivet
  184. Udgivet

    Nitrogenase gene amplicons from global marine surface waters are dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A. F., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Steward, G. F., Hagström, Å. & Riemann, Lasse, 2011, I: P L o S One. 6, 4, s. e19223 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  185. Udgivet

    Predominant genera of fecal microbiota in children with atopic dermatitis are not altered by intake of probiotic bacteria Lactobacillus acidophilus NCFM and Bifidobacterium animalis subsp.lactis Bi-07

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, Gøbel, R. J., Michaelsen, Kim F., Abu Al-Soud, W., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2011, I: FEMS Microbiology Ecology. 75, 3, s. 482-496 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  186. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  187. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  188. 2010
  189. Udgivet

    Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing

    Holmsgaard, P. N., Poulsen, P., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  190. Udgivet

    Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Filed Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, nov. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  191. Udgivet

    The effect of L. acidophilus NCFM intake on insulin sensitivity and gut microbiota: a randomized placebo-controlled trial

    Larsen, Nadja, Andreasen, A. S., Pedersen-Skovsgaard, T., Møller, K., van den Berg, F. W. J., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Nielsen, Dennis Sandris, Vogensen, Finn Kvist, Pedersen, Bente Klarlund & Jakobsen, M., sep. 2010.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  192. Udgivet
  193. Udgivet

    Bias in Nycodenz extraction from bulk soil analysed by amplicon high throughput sequencing

    Holmsgaard, P. N., Poulsen, P. H. B., Hede, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  194. Udgivet

    Metamobilomics - Expanding the environmental mobilome with high throughput sequencing

    Norman, A., Li, L., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  195. Udgivet

    The Diversity of cultural and uncultrural Pseudomonas in an Urban Waste Field Trial

    Li, L., Bergmark, L., Abu Al-Soud, W., Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, aug. 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  196. Udgivet
  197. Udgivet

    Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van der Berg, Franciscus Winfried J, Nielsen, Dennis Sandris, Andreasen, Anne Sofie, Pedersen, Bente Klarlund, Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010, I: PLoS ONE. 5, 2, s. e9085 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  198. Udgivet

    The gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

    Nielsen, Dennis Sandris, Larsen, Nadja, Vogensen, Finn Kvist, van den Berg, F. W. J., Andreasen, A. S., Pedersen, B. K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Jakobsen, M., 2010. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  199. Udgivet
  200. Udgivet

    The nitrogenase gene pool in surface waters of the global ocean is dominated by genes of non-cyanobacteria

    Farnelid, H., Andersson, A., Bertilsson, S., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Hagström & Riemann, Lasse, 2010.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  201. 2009
  202. Udgivet

    All IncP-1 plasmid subgroups, including the novel e subgroup, are prevalent in the influent of a Danish wastewater treatment plant

    Bahl, M. I., Burmølle, Mette, Meisner, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Plasmid. 62, 2, s. 134-139 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  203. Udgivet

    Characterization of genetic determinants of extended-spectrum cephalosporinases (ESCs) in Escherichia coli isolates from Danish and imported poultry meat

    Bergenholtz, R. D., Jørgensen, M. S., Hansen, Lars Hestbjerg, Jensen, L. B. & Hasman, H., 2009, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 64, 1, s. 207-209 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  204. Udgivet

    Conjugative plasmids: Vessels of the communal gene pool

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 364, 1527, s. 2275-2289 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  205. Udgivet

    Construction and Use of Flow Cytometry Optimized Plasmid-Sensor Strains: Genomes in Flux

    Bahl, M. I., Oregaard, G., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2009, Horizontal Gene Transfer. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 257-268 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  206. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg, Magid, Jakob & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  207. Udgivet

    Investigation of prokaryotic diversity in an urban waste field trial by high throughput sequencing

    Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  208. Udgivet

    Persistence Mechanisms of Conjugative Plasmids

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, Horizontal Gene Transfer: Genomes in Flux. Gogarten, M. B., Gogarten, J. P. & Olendzenski, L. C. (red.). Humana Press, Bind 532. s. 73-102 (Methods in Molecular Biology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  209. Udgivet

    The presence of embedded bacterial pure cultures in agar plates stimulate the culturability of soil bacteria.

    Burmølle, Mette, Johnsen, K., Abu Al-Soud, W. M. A. F., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2009, I: Journal of Microbiological Methods. 79, 2, s. 166-173 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  210. 2008
  211. Udgivet

    Characterisation, dissemination and persistence of gentamicin resistant Escherichia coli from a Danish university hospital to the waste water environment

    Jakobsen, L., Sandvang, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Bagger-Skjøt, L., Westh, Henrik T., Jørgensen, C., Hansen, D. S., Pedersen, B. M., Monnet, D. L., Frimodt-Møller, N., Sørensen, Søren Johannes & Hammerum, A. M., 2008, I: Environment International. 34, 1, s. 108-15 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  212. Udgivet

    Nucleotide sequence of pOLA52: a conjugative IncX1 plasmid from Escherichia coli which enables biofilm formation and multidrug efflux

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg, She, Q. & Sørensen, Søren Johannes, 2008, I: Plasmid. 60, 1, s. 59-74 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  213. Udgivet

    Type 3 fimbriae, encoded by the conjugative plasmid pOLA52, enhance biofilm formation and transfer frequencies in Enterobacteriaceae strains

    Burmølle, Mette, Bahl, M. I., Jensen, L. B., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2008, I: Microbiology. 154, Pt 1, s. 187-95 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  214. Udgivet

    Zackenberg Basic: The BioBasic programme

    Hansen, J., Hansen, Lars Hestbjerg, Tamstrof, M., Christoffersen, Kirsten Seestern, Jeppesen, E. & Schmidt, N. M., 2008, Zackenberg Ecological Research Operations, 13th Annual Report 2007: Danish Polar Center 2008, Danish Agency for Science, Technology and Innovation, Ministry of Science, Technology and Innovation. Klitgaard, A. B. & Rasch, M. (red.). Copenhagen: Danish Polar Center, s. 57-69

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til rapportFormidling

  215. 2007
  216. Udgivet

    Conjugative transfer facilitates stable maintenance of IncP-1 plasmid pKJK5 in Escherichia coli cells colonizing the gastrointestinal tract of the germfree rat

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Applied and Environmental Microbiology. 73, 1, s. 341-343

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  217. Udgivet

    Establishment and early succession of a multispecies biofilm composed of soil bacteria

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Microbial Ecology. 54, 2, s. 352-62 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  218. Udgivet

    Impact of conjugal transfer on the stability of IncP-1 plasmid pKJK5 in bacterial populations

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: FEMS Microbiology Letters. 266, s. 250-256

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  219. Udgivet

    Substrate specificity of the OqxAB multidrug resistance pump in Escherichia coli and selected enteric bacteria

    Hansen, Lars Hestbjerg, Jensen, L. B., Sørensen, H. I. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 60, 1, s. 145-147

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  220. Udgivet

    The cda GenoTox assay: A new sensitive method for detection of environmental genotoxins, including nitroarenes and aromatic amines

    Østergaard, T. G., Hansen, Lars Hestbjerg, Binderup, M., Norman, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Mutation Research - Reviews. 631, 2, s. 77-84

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  221. Udgivet

    The multiple antibiotic resistance IncP-1 plasmid pKJK5 isolated from a soil environment is phylogenetically divergent from members of the previously established a, ß and d sub-groups

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Goesmann, A. & Sørensen, Søren Johannes, 2007, I: Plasmid. 58, 1, s. 31-43

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  222. 2006
  223. Udgivet

    A flow cytometry-optimized assay using an SOS-green fluorescent protein (SOS-GFP) whole-cell biosensor for the detection of genotoxins in complex environments

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, I: Mutation Research - Reviews. 603, 2, s. 164-172 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  224. Udgivet

    Biosensors to Monitor Soil Health or Toxicity

    Poulsen, P. H., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Modern Soil Microbiology. van Elsas, J. D., Jansson, J. K. & Trevors, J. T. (red.). 2nd udg. Boca Raton, FL: CRC Press, s. 435-454

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  225. Udgivet

    Determination of the genetic background for resistance to olaquindox, a Gram-negative growth promoter

    Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Jensen, L. B., 2006, I: DANMAP 2005 - July 2006. s. 100-100 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  226. Udgivet

    Enhanced Biofilm Formation and Increased Resistance to Antimicrobial Agents and Bacterial Invasion Are Caused by Synergistic Interactions in Multispecies Biofilms

    Burmølle, Mette, Webb, J. S., Rao, D., Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Kjelleberg, S., 2006, I: Applied and Environmental Microbiology. 72, 6, s. 3916-3923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  227. Udgivet

    Genetic labelling and application of the isoproturonmineralizing Sphingomonas sp. strain SRS2 in soil and rhizosphere

    Kristensen, K. E., Jacobsen, C. S., Hansen, Lars Hestbjerg, Aamand, J., Morgan, J. A. W., Sternberg, C. & Sørensen, S. R., 2006, I: Letters in Applied Microbiology. 43, 3, s. 280-286 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  228. Udgivet

    Making bio-sense of toxicity: new developments in whole-cell biosencors

    Sørensen, Søren Johannes, Burmølle, Mette & Hansen, Lars Hestbjerg, 2006, I: Current Opinion in Biotechnology. 17, 1, s. 11-16

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  229. Udgivet

    Reporter Geneechnology in Soil Ecology; Detection of Bioavailability and Microbial Interactions

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2006, Nucleic Acids and Proteins in Soil. Tyskland: Springer, s. 397-419

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  230. 2005
  231. Udgivet

    Construction of a ColD cda Promoter-Based SOS-Green Fluorescent Protein Whole-Cell Biosensor with Higher Sensitivity toward Genotoxic Compounds than Constructs Based on recA, umuDC, or sulA Promoters

    Norman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: Applied and Environmental Microbiology. 71, 5, s. 2338-2346

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  232. Udgivet

    Construction of an extended range whole-cell tetracycline biosensor by use of the tet(M) resistance gene

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: FEMS Microbiology Letters. 253, 2, s. 201-205

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  233. Udgivet

    Studying plasmid horizontal transfer in situ: a critical review

    Sørensen, Søren Johannes, Bailey, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Kroer, Niels & Wuertz, S., 2005, I: Nature Reviews. Microbiology. 3, 9, s. 700-710

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskning

  234. Udgivet

    The Prevalence of the OqxAB Multidrug Efflux Pump amongst Olaquindox-Resistant Escherichia coli in Pigs

    Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes, Jørgensen, H. S. & Jensen, L. B., 2005, I: Microbial Drug Resistance. 11, 4, s. 378-382

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  235. Udgivet

    Use of a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry to Detect AHL Production by an Indigenous Soil Community During Decomposition

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2005, I: Microbial Ecology. 50, 2, s. 221-229

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  236. 2004
  237. Udgivet

    In Vivo Detection and Quantification of Tetracycline by Use of a Whole-Cell Biosensor in the Rat Intestine

    Bahl, M. I., Hansen, Lars Hestbjerg, Licht, T. R. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 48, 4, s. 1112-1117

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  238. Udgivet

    Application of whole-cell biosensors in soil

    Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg, Burmølle, Mette, Oregaard, G. & Hermansen, P., 2004, Molecular Microbial Ecology Manual. Kowalchuk, G. A., de Bruijn, F. J., Head, I. M., Akkermans, A. D. L. & van Elsas, J. D. (red.). 2. ed udg. Kluwer Academic Publishers, s. 1613-1628 8.03

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  239. Udgivet

    Effect of Tetracycline on Transfer and Establishment of the Tetracycline-Inducible Conjugative Transposon Tn916 in the Guts of Gnotobiotic Rats

    Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes, Hansen, Lars Hestbjerg & Licht, T. R., 2004, I: Applied and Environmental Microbiology. 70, 2, s. 758-764

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  240. Udgivet

    Plasmid Encoded Multidrug Efflux Pump Conferring Resistance to Olaquindox in Escherichia coli

    Hansen, Lars Hestbjerg, Johannesen, E., Burmølle, Mette, Sørensen, A. H. & Sørensen, Søren Johannes, 2004, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 48, 9, s. 3332-3337

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  241. Udgivet

    Quantification of plasmid loss in Escherichia coli cells by use of flow cytometry

    Bahl, M. I., Sørensen, Søren Johannes & Hansen, Lars Hestbjerg, 2004, I: FEMS Microbiology Letters. 232, 1, s. 45-49

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  242. 2003
  243. Udgivet

    Conjugative Plasmid Conferring Resistance to Olaquindox

    Sørensen, A. H., Hansen, Lars Hestbjerg, Johannesen, E. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Antimicrobial agents and Chemotheraphy. 47, 2, s. 798-799 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  244. Udgivet

    Direct Detection and Quantification of Horizontal Gene Transfer Using Flow Cytometry and gfp as a Reporter Gene

    Sørensen, Søren Johannes, Sørensen, A. H., Hansen, Lars Hestbjerg, Oregaard, G. & Veal, D., 2003, I: Current Microbiology. 47, 2, s. 129-133 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  245. Udgivet

    In Situ Exposure to Low Herbicide Concentrations Affects Microbial Population Composition and Catabolic Gene Frequency in an Aerobic Shallow Aquifer

    de Lipthay, J. R., Tuxen, N., Johnsen, K., Hansen, Lars Hestbjerg, Albrechtsen, H., Bjerg, P. L. & Aamand, J., 2003, I: Applied and Environmental Microbiology. 69, 1, s. 461-467 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  246. Udgivet

    Presence of N-acyl Homoserine Lactones in Soil Detected by a Whole-Cell Biosensor and Flow Cytometry

    Burmølle, Mette, Hansen, Lars Hestbjerg, Oregaard, G. & Sørensen, Søren Johannes, 2003, I: Microbial Ecology. 45, 3, s. 226-236 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  247. 2002
  248. Udgivet

    Molecular methods for assessing and manipulating the diversity of microbial populations and processes

    Sørensen, Søren Johannes, de Lipthay, J. R., Müller, A. K., Barkay, T., Hansen, Lars Hestbjerg & Rasmussen, L. D., 2002, Enzymes in the Environment: Activity, Ecology, and Applications. Burns, R. G. & Dick, R. P. (red.). Marcel Dekker, 363 s. (Books in soils, plants, and the environment).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  249. Udgivet

    Quantification of bioavailable chlortetracycline in pig feces using a bacterial whole-cell biosensor

    Hansen, Lars Hestbjerg, Aarestrup, F. & Sørensen, Søren Johannes, 2002, I: Veterinary Microbiology. 87, 1, s. 51-57

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  250. 2001
  251. Udgivet

    Detection of Oxytetracycline production by Streptomyces rimosus in soil microcosms by combining whole-cell biosensors and flow cytometry

    Hansen, Lars Hestbjerg, Ferrari, B., Sørensen, A. H., Veal, D. & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: Applied and Environmental Microbiology. 67, 1, s. 239-244

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  252. Udgivet

    Group-specific PCR primers to amplify 24S α-subunit rRNA genes from Kinetoplastida (Protozoa) used in denaturing gradient gel electrophoresis

    Rasmussen, L. D., Ekelund, Flemming, Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Johnsen, K., 2001, I: Microbial Ecology. 42, 2, s. 109-115

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  253. Udgivet

    The use of whole-cell biosensors to detect and quantify compounds or conditions affecting biological systems

    Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2001, I: Microbial Ecology. 42, 4, s. 483-494

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  254. 2000
  255. Udgivet

    Detection and quantification of tetracyclines by whole cell biosensors

    Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2000, I: FEMS Microbiology Letters. 190, 2, s. 273-278

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  256. Udgivet

    Versatile biosensor vectors for detection and quantification of mercury

    Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, Søren Johannes, 2000, I: FEMS Microbiology Letters. 193, 1, s. 123-127

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  257. 1998
  258. Udgivet

    The effect of the lacY gene on the induction of IPTG inducible promoters, studied in Escherichia coli and Pseudomonas fluorescens

    Hansen, Lars Hestbjerg, Knudsen, S. & Sørensen, Søren Johannes, 1998, I: Current Microbiology. 36, 6, s. 341-347

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  259. 1997
  260. Udgivet

    The role of GH receptor tyrosine phosphorylation in Stat5 activation

    Hansen, J. A., Hansen, Lars Hestbjerg, Wang, X., Kopchick, J. J., Gouilleux, F., Groner, B., Møldrup, A., Galsgaard, E. D., Nielsen, Jens Høiriis & Billestrup, Nils, jun. 1997, I: Journal of Molecular Endocrinology. 18, 3, s. 213-21 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  261. Udgivet

    Chromosomal insertion of the entire Escherichia coli lactose operon, into two strains of Pseudomonas, using a modified mini-Tn5 delivery system

    Hansen, Lars Hestbjerg, Sørensen, Søren Johannes & Jensen, L. B., 1997, I: Gene. 186, 2, s. 167-173

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  262. 1995
  263. Udgivet

    Development and testing of improved suicide functions for biological containment of bacteria

    Knudsen, S., Saadbye, P., Hansen, Lars Hestbjerg, Collier, A., Jacobsen, B. L., Schlundt, J. & Karlström, O. H., 1995, I: Applied and Environmental Microbiology. 61, 3, s. 985-991 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4930