Witold Piotr Kot

Witold Piotr Kot

Tenure Track Adjunkt


  1. Udgivet

    Detection of preQ0 deazaguanine modifications in bacteriophage CAjan DNA using Nanopore sequencing reveals same hypermodification at two distinct DNA motifs

    Kot, Witold, Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hutinet, G., de Crecy-Lagard, V., Cui, L., Dedon, P. C., Carstens, Alexander Byth, Moineau, S., Swairjo, M. A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Nucleic Acids Symposium Series. 48, 18, s. 10383-10396 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Pedersen, P. D., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  3. Udgivet

    Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages

    Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  4. Udgivet

    Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms

    Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Presentation of Three Novel Tailed Phages Targeting Multiple Strains of Pseudomonas syringae

    Jørgensen, J. B., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Neve, H., Morris, C. E. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 245-250 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Characterization of the Vaginal DNA Virome in Health and Dysbiosis

    Jakobsen, Rasmus Riemer, Haahr, T., Humaidan, P., Jensen, J. S., Kot, Witold, Castro-Mejia, J. L., Deng, Ling, Leser, T. D. & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Viruses. 12, 10, 13 s., 1143.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Administration of bovine milk oligosaccharide to weaning gnotobiotic mice inoculated with a simplified infant type microbiota

    Jakobsen, L. M. A., Sundekilde, U. K., Andersen, H. J., Kot, Witold, Mejia, J. L. C., Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Axel Kornerup & Bertram, H. C., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 1003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Two novel bacteriophage genera from a groundwater reservoir highlight subsurface environments as underexplored biotopes in bacteriophage ecology

    Hylling, O., Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Hansen, M., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Johansen, A., Ellegaard-Jensen, L. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Supplementation of a lacto-fermented rapeseed-seaweed blend promotes gut microbial- and gut immune-modulation in weaner piglets

    Hui, Y., Tamez-Hidalgo, P., Cieplak, T., Satessa, G. D., Kot, Witold, Kjærulff, S., Nielsen, M. O., Nielsen, Dennis Sandris & Krych, Lukasz, 2021, I: Journal of Animal Science and Biotechnology. 12, 14 s., 85.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Donor-dependent fecal microbiota transplantation efficacy against necrotizing enterocolitis in preterm pigs

    Hui, Y., Vestergaard, G., Deng, Ling, Kot, Witold, Thymann, Thomas, Brunse, Anders & Nielsen, Dennis Sandris, 2022, I: npj Biofilms and Microbiomes. 8, 1, 12 s., 48.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Pretreatment Prevotella-to-Bacteroides ratio and salivary amylase gene copy number as prognostic markers for dietary weight loss

    Hjorth, Mads Fiil, Christensen, Lars, Larsen, T. M., Roager, Henrik Munch, Krych, Lukasz, Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris, Ritz, C. & Astrup, A., 2020, I: American Journal of Clinical Nutrition. 111, 5, s. 1079-1086 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Bacteriophages Roam the Wheat Phyllosphere

    Forero Junco, Laura Milena, Alanin, K. W. S., Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold, Gobbi, Alex & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: Viruses. 14, 2, 13 s., 244.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Complete Genome Sequences of Three Lactiplantibacillus plantarum Strains Isolated from Traditional Iranian Raw Milk Motal Cheese

    Fatemizadeh, S. S., Krych, Lukasz, Castro-Mejía, J. L., Stefanova, Denitsa Vladimirova, Kot, Witold, Najafi, M. B. H. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: Microbiology Resource Announcements. 12, 1, 3 s., e0047922.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Degradation of mecoprop in polluted landfill leachate and waste water in a moving bed biofilm reactor

    Escolà Casas, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Johansen, A. & Bester, K., 2017, I: Water Research. 121, s. 213-220

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria

    Dougherty, Peter Erdmann, Nielsen, Tue Kjærgaard, Riber, Leise, Lading, H. H., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Raaijmakers, J. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Two New Dickeya dadantii Phages with Odd Growth Patterns Expand the Diversity of Phages Infecting Soft Rot Pectobacteriaceae

    Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 251-259 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Restitution of gut microbiota in Ugandan children administered with probiotics (Lactobacillus rhamnosus GG and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12) during treatment for severe acute malnutrition

    Castro-Mejía, J. L., O’Ferrall, S., Krych, Lukasz, O’Mahony, E., Namusoke, H., Lanyero, B., Kot, Witold, Nabukeera-Barungi, N., Michaelsen, Kim F., Mølgaard, Christian, Friis, Henrik, Grenov, Benedikte & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut Microbes. 11, 4, s. 855-867 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Physical fitness in community-dwelling older adults is linked to dietary intake, gut microbiota, and metabolomic signatures

    Castro-Mejia, J. L., Khakimov, B., Krych, L., Bülow, J., Bechshøft, R. L., Højfeldt, G., Mertz, K. H., Garne, E. S., Schacht, S. R., Ahmad, H. F., Kot, W., Hansen, L. H., Perez-Cueto, F. J. A., Lind, M. V., Lassen, A. J., Tetens, I., Jensen, T., Reitelseder, S., Jespersen, A. P., Holm, L. & 2 flere, Engelsen, Søren Balling & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Aging Cell. 19, 3, 13 s., e13105.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Optimizing protocols for extraction of bacteriophages prior to metagenomic analyses of phage communities in the human gut

    Castro Mejia, J. L., Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, L. H., Vogensen, Finn Kvist & Nielsen, Dennis Sandris, 2015, I: Microbiome. 3, 14 s., 64.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    A novel six-phage cocktail reduces Pectobacterium atrosepticum soft rot infection in potato tubers under simulated storage conditions

    Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 maj 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 9, s. 1-8 fnz101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Fecal filtrate transplantation protects against necrotizing enterocolitis

    Brunse, Anders, Deng, Ling, Pan, X., Hui, Y., Castro Mejia, J. L., Kot, Witold, Nguyen, Duc Ninh, Secher, Jan Bojsen-Møller, Nielsen, Dennis Sandris & Thymann, Thomas, 2022, I: The ISME Journal. 16, s. 686–694

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The Mobilome: Metagenomic Analysis of Circular Plasmids, Viruses, and Other Extrachromosomal Elements

    Browne, Patrick Denis, Kot, Witold, Jørgensen, T. S. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, Horizontal Gene Transfer: Methods and Protocols. Cruz, F. D. L. (red.). Humana Press, s. 253-264 (Methods in Molecular Biology, Bind 2075).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms

    Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Novel virocell metabolic potential revealed in agricultural soils by virus-enriched soil metagenome analysis

    Braga, L. P. P., Coutinho, F. H., Amgarten, D. E., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2021, I: Environmental Microbiology Reports. 13, 3, s. 348-354 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Impact of phages on soil bacterial communities and nitrogen availability under different assembly scenarios

    Braga, L. P. P., Spor, A., Kot, Witold, Breuil, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2020, I: Microbiome. 8, 1, 14 s., 52.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 15105675