Witold Piotr Kot
Tenure Track Adjunkt
Microbial Ecology and Biotechnology
Thorvaldsensvej 40
1871 Frederiksberg C
- Udgivet
Detection of preQ0 deazaguanine modifications in bacteriophage CAjan DNA using Nanopore sequencing reveals same hypermodification at two distinct DNA motifs
Kot, Witold, Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hutinet, G., de Crecy-Lagard, V., Cui, L., Dedon, P. C., Carstens, Alexander Byth, Moineau, S., Swairjo, M. A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Nucleic Acids Symposium Series. 48, 18, s. 10383-10396 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Neve, H., Hammer, K., Sørensen, Søren Johannes, Heller, K. J. & Vogensen, Finn Kvist, 2011. 1 s.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
- Udgivet
Metagenomic analysis of a keratin-degrading bacterial consortium provides insight into the keratinolytic mechanisms
Kang, D., Huang, Y., Nesme, Joseph, Herschend, J., Jacquiod, S., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lange, L. & Sørensen, Søren Johannes, 2021, I: Science of the Total Environment. 761, 9 s., 143281.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Presentation of Three Novel Tailed Phages Targeting Multiple Strains of Pseudomonas syringae
Jørgensen, J. B., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Neve, H., Morris, C. E. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 245-250 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of the Vaginal DNA Virome in Health and Dysbiosis
Jakobsen, Rasmus Riemer, Haahr, T., Humaidan, P., Jensen, J. S., Kot, Witold, Castro-Mejia, J. L., Deng, Ling, Leser, T. D. & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Viruses. 12, 10, 13 s., 1143.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Administration of bovine milk oligosaccharide to weaning gnotobiotic mice inoculated with a simplified infant type microbiota
Jakobsen, L. M. A., Sundekilde, U. K., Andersen, H. J., Kot, Witold, Mejia, J. L. C., Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Axel Kornerup & Bertram, H. C., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 1003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Two novel bacteriophage genera from a groundwater reservoir highlight subsurface environments as underexplored biotopes in bacteriophage ecology
Hylling, O., Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Hansen, M., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Johansen, A., Ellegaard-Jensen, L. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Supplementation of a lacto-fermented rapeseed-seaweed blend promotes gut microbial- and gut immune-modulation in weaner piglets
Hui, Y., Tamez-Hidalgo, P., Cieplak, T., Satessa, G. D., Kot, Witold, Kjærulff, S., Nielsen, M. O., Nielsen, Dennis Sandris & Krych, Lukasz, 2021, I: Journal of Animal Science and Biotechnology. 12, 14 s., 85.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Donor-dependent fecal microbiota transplantation efficacy against necrotizing enterocolitis in preterm pigs
Hui, Y., Vestergaard, G., Deng, Ling, Kot, Witold, Thymann, Thomas, Brunse, Anders & Nielsen, Dennis Sandris, 2022, I: npj Biofilms and Microbiomes. 8, 1, 12 s., 48.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pretreatment Prevotella-to-Bacteroides ratio and salivary amylase gene copy number as prognostic markers for dietary weight loss
Hjorth, Mads Fiil, Christensen, Lars, Larsen, T. M., Roager, Henrik Munch, Krych, Lukasz, Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris, Ritz, C. & Astrup, A., 2020, I: American Journal of Clinical Nutrition. 111, 5, s. 1079-1086 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
- Udgivet
Complete Genome Sequences of Three Lactiplantibacillus plantarum Strains Isolated from Traditional Iranian Raw Milk Motal Cheese
Fatemizadeh, S. S., Krych, Lukasz, Castro-Mejía, J. L., Stefanova, Denitsa Vladimirova, Kot, Witold, Najafi, M. B. H. & Nielsen, Dennis Sandris, 2023, I: Microbiology Resource Announcements. 12, 1, 3 s., e0047922.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Degradation of mecoprop in polluted landfill leachate and waste water in a moving bed biofilm reactor
Escolà Casas, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Johansen, A. & Bester, K., 2017, I: Water Research. 121, s. 213-220Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria
Dougherty, Peter Erdmann, Nielsen, Tue Kjærgaard, Riber, Leise, Lading, H. H., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Raaijmakers, J. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Two New Dickeya dadantii Phages with Odd Growth Patterns Expand the Diversity of Phages Infecting Soft Rot Pectobacteriaceae
Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 251-259 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Restitution of gut microbiota in Ugandan children administered with probiotics (Lactobacillus rhamnosus GG and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12) during treatment for severe acute malnutrition
Castro-Mejía, J. L., O’Ferrall, S., Krych, Lukasz, O’Mahony, E., Namusoke, H., Lanyero, B., Kot, Witold, Nabukeera-Barungi, N., Michaelsen, Kim F., Mølgaard, Christian, Friis, Henrik, Grenov, Benedikte & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut Microbes. 11, 4, s. 855-867 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physical fitness in community-dwelling older adults is linked to dietary intake, gut microbiota, and metabolomic signatures
Castro-Mejia, J. L., Khakimov, B., Krych, L., Bülow, J., Bechshøft, R. L., Højfeldt, G., Mertz, K. H., Garne, E. S., Schacht, S. R., Ahmad, H. F., Kot, W., Hansen, L. H., Perez-Cueto, F. J. A., Lind, M. V., Lassen, A. J., Tetens, I., Jensen, T., Reitelseder, S., Jespersen, A. P., Holm, L. & 2 flere, , 2020, I: Aging Cell. 19, 3, 13 s., e13105.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimizing protocols for extraction of bacteriophages prior to metagenomic analyses of phage communities in the human gut
Castro Mejia, J. L., Muhammed, Musemma Kedir, Kot, Witold, Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, L. H., Vogensen, Finn Kvist & Nielsen, Dennis Sandris, 2015, I: Microbiome. 3, 14 s., 64.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A novel six-phage cocktail reduces Pectobacterium atrosepticum soft rot infection in potato tubers under simulated storage conditions
Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 maj 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 9, s. 1-8 fnz101.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fecal filtrate transplantation protects against necrotizing enterocolitis
Brunse, Anders, Deng, Ling, Pan, X., Hui, Y., Castro Mejia, J. L., Kot, Witold, Nguyen, Duc Ninh, Secher, Jan Bojsen-Møller, Nielsen, Dennis Sandris & Thymann, Thomas, 2022, I: The ISME Journal. 16, s. 686–694Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Mobilome: Metagenomic Analysis of Circular Plasmids, Viruses, and Other Extrachromosomal Elements
Browne, Patrick Denis, Kot, Witold, Jørgensen, T. S. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, Horizontal Gene Transfer: Methods and Protocols. Cruz, F. D. L. (red.). Humana Press, s. 253-264 (Methods in Molecular Biology, Bind 2075).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms
Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel virocell metabolic potential revealed in agricultural soils by virus-enriched soil metagenome analysis
Braga, L. P. P., Coutinho, F. H., Amgarten, D. E., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2021, I: Environmental Microbiology Reports. 13, 3, s. 348-354 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of phages on soil bacterial communities and nitrogen availability under different assembly scenarios
Braga, L. P. P., Spor, A., Kot, Witold, Breuil, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2020, I: Microbiome. 8, 1, 14 s., 52.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 15105675
Flest downloads
-
3030
downloads
Sequence and comparative analysis of Leuconostoc dairy bacteriophages
Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
Udgivet -
1777
downloads
Bacteriophages of Leuconostoc, Oenococcus, and Weissella
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1281
downloads
Genome sequence of Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris strain T26, isolated from mesophilic undefined cheese starter
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet