Witold Piotr Kot

Witold Piotr Kot

Tenure Track Adjunkt


  1. 2019
  2. Udgivet

    Genomic and Ecogenomic Characterization of Proteus mirabilis Bacteriophages

    Alves, D. R., Nzakizwanayo, J., Dedi, C., Olympiou, C., Hanin, A., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Lametsch, Rene, Gahan, C. G. M., Schellenberger, P., Ogilvie, L. A. & Jones, B. V., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-14 1783.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Gut and immune effects of bioactive milk factors in preterm pigs exposed to prenatal inflammation

    Ren, S., Hui, Y., Goericke-Pesch, S., Pankratova, Stanislava, Kot, Witold, Pan, X., Thymann, Thomas, Sangild, Per Torp & Nguyen, Duc Ninh, 2019, I: American Journal of Physiology: Gastrointestinal and Liver Physiology. 317, 1, s. G67-G77

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Mouse vendor influence on the bacterial and viral gut composition exceeds the effect of diet

    Rasmussen, Torben Sølbeck, de Vries, L., Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Castro-Mejía, J. L., Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Axel Kornerup & Nielsen, Dennis Sandris, 2019, I: Viruses. 11, 5, 15 s., 435.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Short communication: Gut microbial colonization of the mouse colon using faecal transfer was equally effective when comparing rectal inoculation and oral inoculation based on 16S rRNA sequencing

    Lützhøft, Ditte Olsen, Sánchez-Alcoholado, L., Tougaard, P., Mentzel, Caroline M. Junker, Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2019, I: Research in Veterinary Science. 126, s. 227-232 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    A novel six-phage cocktail reduces Pectobacterium atrosepticum soft rot infection in potato tubers under simulated storage conditions

    Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 1 maj 2019, I: FEMS Microbiology Letters. 366, 9, s. 1-8 fnz101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  7. 2020
  8. Udgivet

    A Humanized Diet Profile May Facilitate Colonization and Immune Stimulation in Human Microbiota-Colonized Mice

    Moreno-Indias, I., Lundberg, R., Krych, Lukasz, Metzdorff, S. B., Kot, Witold, Sørensen, Dorte Bratbo, Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Camilla Hartmann Friis & Hansen, Axel Kornerup, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 15 s., 1336.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    A New High-Throughput Screening Method for Phages: Enabling Crude Isolation and Fast Identification of Diverse Phages with Therapeutic Potential

    Olsen, N. S., Hendriksen, N. B., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 3, s. 137-148

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A Rare, Virulent Clostridium perfringens Bacteriophage Susfortuna Is the First Isolated Bacteriophage in a New Viral Genus

    Pedersen, Julie Stenberg, Kot, Witold, Plöger, M., Lametsch, Rene, Neve, H., Franz, C. M. A. P. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 230-236 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Characterization of the Vaginal DNA Virome in Health and Dysbiosis

    Jakobsen, Rasmus Riemer, Haahr, T., Humaidan, P., Jensen, J. S., Kot, Witold, Castro-Mejia, J. L., Deng, Ling, Leser, T. D. & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Viruses. 12, 10, 13 s., 1143.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Detection of preQ0 deazaguanine modifications in bacteriophage CAjan DNA using Nanopore sequencing reveals same hypermodification at two distinct DNA motifs

    Kot, Witold, Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hutinet, G., de Crecy-Lagard, V., Cui, L., Dedon, P. C., Carstens, Alexander Byth, Moineau, S., Swairjo, M. A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Nucleic Acids Symposium Series. 48, 18, s. 10383-10396 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment

    Olsen, Nikoline S., Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Viruses. 12, 9, 21 s., 986.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Faecal virome transplantation decreases symptoms of type 2 diabetes and obesity in a murine model

    Rasmussen, Torben Sølbeck, Mentzel, Caroline M. Junker, Kot, Witold, Castro-Mejiá, J. L., Zuffa, S., Swann, J. R., Hansen, Lars Hestbjerg, Vogensen, Finn Kvist, Hansen, Axel Kornerup & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut. 69, 12, s. 2122-2130 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms

    Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Housing temperature influences exercise training adaptations in mice

    Raun, Steffen Henning, Henriquez-Olguín, Carlos, Karavaeva, Iuliia, Ali, Mona Sadek, Møller, Lisbeth L V, Kot, Witold, Castro-Mejía, J. L., Nielsen, Dennis Sandris, Gerhart-Hines, Zach, Richter, Erik A. & Sylow, Lykke, 2020, I: Nature Communications. 11, 16 s., 1560.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Impact of phages on soil bacterial communities and nitrogen availability under different assembly scenarios

    Braga, L. P. P., Spor, A., Kot, Witold, Breuil, M., Hansen, Lars Hestbjerg, Setubal, J. C. & Philippot, L., 2020, I: Microbiome. 8, 1, 14 s., 52.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Isolation and characterisation of novel phages infecting Lactobacillus plantarum and proposal of a new genus, "Silenusvirus"

    Kyrkou, I., Carstens, Alexander Byth, Ellegaard-Jensen, L., Kot, Witold, Zervas, A., Djurhuus, Amaru Miranda, Neve, H., Franz, C. M. A. P., Hansen, M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 10 s., 8763.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Pectobacterium Phage Jarilo Displays Broad Host Range and Represents a Novel Genus of Bacteriophages Within the Family Autographiviridae

    Pedersen, Julie Stenberg, Carstens, Alexander Byth, Djurhuus, Amaru Miranda, Kot, Witold, Neve, H. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 237-244 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Physical fitness in community-dwelling older adults is linked to dietary intake, gut microbiota, and metabolomic signatures

    Castro-Mejia, J. L., Khakimov, B., Krych, L., Bülow, J., Bechshøft, R. L., Højfeldt, G., Mertz, K. H., Garne, E. S., Schacht, S. R., Ahmad, H. F., Kot, W., Hansen, L. H., Perez-Cueto, F. J. A., Lind, M. V., Lassen, A. J., Tetens, I., Jensen, T., Reitelseder, S., Jespersen, A. P., Holm, L. & 2 flere, Engelsen, Søren Balling & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Aging Cell. 19, 3, 13 s., e13105.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Presentation of Three Novel Tailed Phages Targeting Multiple Strains of Pseudomonas syringae

    Jørgensen, J. B., Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Neve, H., Morris, C. E. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 245-250 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Pretreatment Prevotella-to-Bacteroides ratio and salivary amylase gene copy number as prognostic markers for dietary weight loss

    Hjorth, Mads Fiil, Christensen, Lars, Larsen, T. M., Roager, Henrik Munch, Krych, Lukasz, Kot, Witold, Nielsen, Dennis Sandris, Ritz, C. & Astrup, A., 2020, I: American Journal of Clinical Nutrition. 111, 5, s. 1079-1086 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Restitution of gut microbiota in Ugandan children administered with probiotics (Lactobacillus rhamnosus GG and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12) during treatment for severe acute malnutrition

    Castro-Mejía, J. L., O’Ferrall, S., Krych, Lukasz, O’Mahony, E., Namusoke, H., Lanyero, B., Kot, Witold, Nabukeera-Barungi, N., Michaelsen, Kim F., Mølgaard, Christian, Friis, Henrik, Grenov, Benedikte & Nielsen, Dennis Sandris, 2020, I: Gut Microbes. 11, 4, s. 855-867 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    The Mobilome: Metagenomic Analysis of Circular Plasmids, Viruses, and Other Extrachromosomal Elements

    Browne, Patrick Denis, Kot, Witold, Jørgensen, T. S. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, Horizontal Gene Transfer: Methods and Protocols. Cruz, F. D. L. (red.). Humana Press, s. 253-264 (Methods in Molecular Biology, Bind 2075).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Two New Dickeya dadantii Phages with Odd Growth Patterns Expand the Diversity of Phages Infecting Soft Rot Pectobacteriaceae

    Djurhuus, Amaru Miranda, Carstens, Alexander Byth, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 251-259 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Two novel bacteriophage genera from a groundwater reservoir highlight subsurface environments as underexplored biotopes in bacteriophage ecology

    Hylling, O., Carstens, Alexander Byth, Kot, Witold, Hansen, M., Neve, H., Franz, C. M. A. P., Johansen, A., Ellegaard-Jensen, L. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. 2021
  28. Udgivet

    Administration of bovine milk oligosaccharide to weaning gnotobiotic mice inoculated with a simplified infant type microbiota

    Jakobsen, L. M. A., Sundekilde, U. K., Andersen, H. J., Kot, Witold, Mejia, J. L. C., Nielsen, Dennis Sandris, Hansen, Axel Kornerup & Bertram, H. C., 2021, I: Microorganisms. 9, 5, 1003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 15105675