Tue Kjærgaard Nielsen

Tue Kjærgaard Nielsen

Tenure Track Adjunkt


  1. Udgivet

    The complete genome of 2,6-dichlorobenzamide (BAM) degrader Aminobacter sp. MSH1 suggests a polyploid chromosome, phylogenetic reassignment, and functions of plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Horemans, B., Lood, C., T’Syen, J., van Noort, V., Lavigne, R., Ellegaard-Jensen, L., Hylling, Ole, Aamand, J., Springael, D. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Scientific Reports. 11, 12 s., 18943.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Detection of nucleotide modifications in bacteria and bacteriophages: Strengths and limitations of current technologies and software

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Forero Junco, Laura Milena, Kot, Witold, Moineau, S., Hansen, Lars Hestbjerg & Riber, Leise, 2023, I: Molecular Ecology. 32, 6, s. 1236-1247 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Genetic rearrangements in Pseudomonas amygdali pathovar aesculi shape coronatine plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Winther-Have, Caroline Sophie W, Thomsen, Iben Margrete, Jackson, R. W., Rabiey, M., Hennessy, Rosanna Catherine, Bak, Frederik, Kot, Witold, Nicolaisen, Mette Haubjerg, Carstens, Alexander Byth & Hansen, Lars Hestbjerg, 2023, I: Infection, Genetics and Evolution. 113, 10 s., 105486.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Antibiotic resistance genes are differentially mobilized according to resistance mechanism

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Browne, Patrick Denis & Hansen, Lars Hestbjerg, 2022, I: GigaScience. 11, 17 s., giac072.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    The Genome of BAM-degrading Aminobacter sp. MSH1 with Several Low Copy Plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Hylling, Ole & Ellegaard-Jensen, L., 2018, 12 s.

    Publikation: Working paperPreprint

  6. Udgivet

    A novel Queuovirinae lineage of Pseudomonas aeruginosa phages encode dPreQ0 DNA modifications with a single GA motif that provide restriction and CRISPR Cas9 protection in vitro

    Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Cui, L., Dedon, P., Neve, H., Hansen, Lars Hestbjerg & Kot, Witold, 2023, I: Nucleic Acids Research. 51, 16, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Metagenomic analysis of planktonic riverine microbial consortia using nanopore sequencing reveals insight into river microbe taxonomy and function: [incl. Erratum]

    Reddington, K., Eccles, D., O'Grady, J., Drown, D. M., Hansen, L. H., Nielsen, T. K., Ducluzeau, A-L., Leggett, R. M., Heavens, D., Peel, N., Snutch, T. P., Bayega, A., Oikonomopoulos, S., Ragoussis, J., Barry, T., van der Helm, E., Jolic, D., Richardson, H., Jansen, H., Tyson, J. R. & 2 flere, Jain, M. & Brown, B. L., 2020, I: GigaScience. 9, 6, 12 s., 053.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Land use as a driver for protist community structure in soils under agricultural use across Europe

    Santos, S. S., Schöler, A., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg, Schloter, M. & Winding, A., 2020, I: Science of the Total Environment. 717, 137228.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Soil DNA extraction procedure influences protist 18S rRNA gene community profiling outcome

    Santos, S. S., Nunes, I. M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Jacquiod, S. J. A., Hansen, L. H. & Winding, A., jul. 2017, I: Protist. 168, 3, s. 283-293 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Comparison of three DNA extraction methods for recovery of soil protist DNA

    Santos, S. S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, L. H. & Winding, A., 2015, I: Journal of Microbiological Methods. 115, s. 13-19 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 217134357