Tue Kjærgaard Nielsen

Tue Kjærgaard Nielsen

Tenure Track Adjunkt

ORCID: 0000-0001-6610-8450

Udgivelsesår:
Alle
1 - 25 ud af 43Pr. side: 25
Sortering: Udgivelsesår
  1. 2013
  2. Udgivet

    Novel insight into the genetic context of the cadAB genes from a 4-chloro-2-methylphenoxyacetic acid-degrading Sphingomonas

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Xu, Z., Gozdereliler, E., Aamand, J., Hansen, Lars Hestbjerg & Sørensen, S. R., 2013, I: P L o S One. 8, 12, 9 s., e83346.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. 2015

  4. Draft Genome Sequence of Isoproturon-Mineralizing Sphingomonas sp. SRS2, Isolated from an Agricultural Field in the United Kingdom

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Sørensen, S. R. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Genome Announcements. 3, 3, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Draft genome sequence of MCPA-degrading Sphingomonas sp. strain ERG5, isolated from a groundwater aquifer in Denmark

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Sørensen, S. R. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2015, I: Genome Announcements. 3, 1, 2 s., e01529-14.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Comparison of three DNA extraction methods for recovery of soil protist DNA

    Santos, S. S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, L. H. & Winding, A., 2015, I: Journal of Microbiological Methods. 115, s. 13-19 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. 2016

  8. Establishment of Bacterial Herbicide Degraders in a Rapid Sand Filter for Bioremediation of Phenoxypropionate-Polluted Groundwater

    Feld, L., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg, Aamand, J. & Albers, C. N., 2016, I: Applied and Environmental Microbiology. 82, 3, s. 878-887

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Use of WGS data for investigation of a long-term NDM-1-producing Citrobacter freundii outbreak and secondary in vivo spread of blaNDM-1 to Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca

    Hammerum, A. M., Hansen, F., Linde Nielsen, H., Jakobsen, L., Stegger, M., Andersen, P. S., Jensen, P., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, L. H., Hasman, H. & Fuglsang-Damgaard, D., nov. 2016, I: Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 71, 11, s. 3117-3124 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Gasification biochar has limited effects on functional and structural diversity of soil microbial communities in a temperate agroecosystem

    Imparato, V., Hansen, Veronika, Santos, S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Giagnoni, L., Hauggaard-Nielsen, H., Johansen, A., Renella, G. & Winding, A., 2016, I: Soil Biology & Biochemistry. 99, s. 128-136 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida strains isolated from Chinese freshwater fish contain a novel genomic island and possible regional-specific mobile genetic elements profiles

    Long, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Leisner, Jørgen, Hansen, L. H., Shen, Z. X., Zhang, Q. Q. & Li, A., sep. 2016, I: F E M S Microbiology Letters. 363, 17, 8 s., 190.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. 2017

  13. Degradation of mecoprop in polluted landfill leachate and waste water in a moving bed biofilm reactor

    Escolà Casas, M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Hansen, Lars Hestbjerg, Johansen, A. & Bester, K., 2017, I: Water Research. 121, s. 213-220

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    The first characterized phage against a member of the ecologically important sphingomonads reveals high dissimilarity against all other known phages

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Carstens, A. B., Browne, P., Lametsch, Rene, Neve, H., Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, I: Scientific Reports. 7, 10 s., 13566.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Evolution of Sphingomonad Gene Clusters Related to Pesticide Catabolism Revealed by Genome Sequence and Mobilomics of Sphingobium herbicidovorans MH

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Rasmussen, M., Demanèche, S., Cecillon, S., Vogel, T. M. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2017, I: Genome Biology and Evolution. 9, 9, s. 2477-2490

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Soil DNA extraction procedure influences protist 18S rRNA gene community profiling outcome

    Santos, S. S., Nunes, I. M., Nielsen, Tue Kjærgaard, Jacquiod, S. J. A., Hansen, L. H. & Winding, A., jul. 2017, I: Protist. 168, 3, s. 283-293 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. 2018
  18. Udgivet

    Mind the gut: genomic insights to population divergence and gut microbial composition of two marine keystone species

    Fietz, K., Hintze, C. O. R., Skovrind, Mikkel, Nielsen, Tue Kjærgaard, Limborg, Morten Tønsberg, Krag, M. A., Palsboll, P. J., Hansen, L. H., Møller, Peter Rask & Gilbert, M Thomas P, 2018, I: Microbiome. 6, 16 s., 82.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Inter-laboratory testing of the effect of DNA blocking reagent G2 on DNA extraction from low-biomass clay samples

    Jacobsen, C. S., Nielsen, T. K., Vester, J. K., Stougaard, P., Nielsen, J. L., Voriskova, J., Winding, A., Baldrian, P., Liu, B., Frostegard, A., Pedersen, D., Tveit, A. T., Svenning, M. M., Tebbe, C. C., Ovreas, L., Jakobsen, P. B., Blazewicz, S. J., Hubablek, V., Bertilsson, S., Hansen, L. H. & 4 flere, Cary, S. C., Holben, W. E., Ekelund, Flemming & Bælum, J., 2018, I: Scientific Reports. 8, s. 1-6 6 s., 5711.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    The Genome of BAM-degrading Aminobacter sp. MSH1 with Several Low Copy Plasmids

    Nielsen, Tue Kjærgaard, Hylling, Ole & Ellegaard-Jensen, L., 2018, 12 s.

    Publikation: Working paper › Preprint

  21. 2019

  22. Expanding the biodiversity of Oenococcus oeni through comparative genomics of apple cider and kombucha strains

    Lorentzen, M. P., Campbell-Sills, H., Jorgensen, T. S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Coton, M., Coton, E., Hansen, L. & Lucas, P. M., 2019, I: BMC Genomics. 20, 330.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Complete Genome Sequences of Highly Arsenite-Resistant Bacteria Brevibacterium sp. Strain CS2 and Micrococcus luteus AS2

    Sher, S., Rehman, A., Hansen, Lars Hestbjerg & Nielsen, Tue Kjærgaard, 2019, I: Microbiology Resource Announcements. 8, 31, 2 s., e00531-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. 2020
  25. Udgivet

    GC bias affects genomic and metagenomic reconstructions, underrepresenting GC-poor organisms

    Browne, Patrick Denis, Nielsen, Tue Kjærgaard, Kot, Witold, Aggerholm, A., Gilbert, M Thomas P, Puetz, Lara Christine, Rasmussen, M., Zervas, A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: GigaScience. 9, 2, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Bone biodeterioration - The effect of marine and terrestrial depositional environments on early diagenesis and bone bacterial community

    Eriksen, A. M. H., Nielsen, Tue Kjærgaard, Matthiesen, H., Carøe, C., Hansen, Lars Hestbjerg, Gregory, D. J., Turner-Walker, G., Collins, Matthew James & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: PLoS ONE. 15, 10 October, 24 s., e0240512.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Releasing the microbes from old bones: the effect of different DNA extraction protocols on microbial community profiling

    Eriksen, A. M. H., Puetz, Lara Christine, Rocha, C., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: STAR: Science & Technology of Archaeological Research. 6, 1, s. 1-15 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Detection of preQ0 deazaguanine modifications in bacteriophage CAjan DNA using Nanopore sequencing reveals same hypermodification at two distinct DNA motifs

    Kot, Witold, Olsen, Nikoline S., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hutinet, G., de Crecy-Lagard, V., Cui, L., Dedon, P. C., Carstens, Alexander Byth, Moineau, S., Swairjo, M. A. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: Nucleic Acids Symposium Series. 48, 18, s. 10383-10396 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Metagenomic analysis of planktonic riverine microbial consortia using nanopore sequencing reveals insight into river microbe taxonomy and function: [incl. Erratum]

    Reddington, K., Eccles, D., O'Grady, J., Drown, D. M., Hansen, L. H., Nielsen, T. K., Ducluzeau, A-L., Leggett, R. M., Heavens, D., Peel, N., Snutch, T. P., Bayega, A., Oikonomopoulos, S., Ragoussis, J., Barry, T., van der Helm, E., Jolic, D., Richardson, H., Jansen, H., Tyson, J. R. & 2 flere, Jain, M. & Brown, B. L., 2020, I: GigaScience. 9, 6, 12 s., 053.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Land use as a driver for protist community structure in soils under agricultural use across Europe

    Santos, S. S., Schöler, A., Nielsen, Tue Kjærgaard, Hansen, Lars Hestbjerg, Schloter, M. & Winding, A., 2020, I: Science of the Total Environment. 717, 137228.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Potential Rhodopsin- and Bacteriochlorophyll-Based Dual Phototrophy in a High Arctic Glacier

    Zeng, Y., Chen, X., Madsen, A. M., Zervas, A., Nielsen, Tue Kjærgaard, Andrei, A., Lund-Hansen, L. C., Liu, Y. & Hansen, Lars Hestbjerg, 2020, I: mBio. 11, 6, 22 s., e02641-20.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. 2021
  33. Udgivet

    Metaviromes Reveal the Dynamics of Pseudomonas Host-Specific Phages Cultured and Uncultured by Plaque Assay

    Alanin, K. W. S., Forero Junco, Laura Milena, Jørgensen, J. B., Nielsen, Tue Kjærgaard, Rasmussen, Morten Arendt, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Viruses. 13, 6, 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 217134357